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Projekt
Integrative Plattform für klinische und genomische Daten zu myeloproliferativen Neoplasien (MPN)
Fachliche Zuordnung
Hämatologie, Onkologie
Förderung
Förderung seit 2019
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 417911533
Dieses Projekt ist von zentraler Bedeutung für die Klinische Forschungsgruppe 344 (CRU 344), da es eine Plattform für die bioinformatische Analyse und Verwaltung von genomischen und klinischen Daten aller Projekte der CRU 344 bietet. Erste Arbeiten der CRU deuten auf die Bedeutung der Interaktionen zwischen myeloischen Zellen, hämatopoetischen Klonen und Stromazellen für das Fortschreiten von ET oder PV zu Myelofibrose hin. Um diese Fragen anzugehen, werden wir unsere bioinformatischen Pipelines, welche derzeit auf die Einzelzell- und Massentranskriptomanalyse ausgerichtet sind, erweitern, um die Analyse der klonalen Hämatopoese mittels Einzelzellsequenzierung und die Analyse der Zell-Zell-Kommunikation mittels räumlicher Transkriptomik und Proteomik zu unterstützen. Diese Methoden werden für die Analyse von Daten eingesetzt, die im Rahmen verschiedener Projekte des CRU erzeugt werden. Darüber hinaus wird diese Serviceplattform ein klinisches und genomisches Data Warehouse einrichten, um unsere klinischen und genomischen MPN-Repositorien weiter zu verbessern. Dieses Data Warehouse wird die Standardisierung von umfangreichen und historischen klinischen Daten aus dem Aachener MPN-Bioregister und die integrative Analyse mit den von dieser CRU produzierten genomischen Daten ermöglichen. Darüber hinaus werden wir die Menge der genomischen Daten durch die Erstellung zusätzlicher Genexpressionsprofile von CD34+-positiven Zellen von MPN-Patienten und durch die Integration von Sequenzierungsdaten aus allen Projekten dieser CRU erweitern.
DFG-Verfahren
Klinische Forschungsgruppen
