Hybrid-Massenspektrometer mit einem Gradienten Fokussierungssystem für die Flüssigkeitschromatographie

• Fachliche Zuordnung: Grundlagen der Biologie und Medizin
• Förderung: Förderung in 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 431335494

Die Massenspektrometrie basierende Proteinanalytik hat sich in den letzten Jahren immer mehr als Schlüsseltechnologie für viele biologische und medizinische Fragestellungen in den Vordergrund gedrängt. Das beantragte Massenspektrometer besticht durch seine eine hohe Sensitivität, schnelle Sequenzierungsgeschwindigkeit, extreme Massengenauigkeit und vielfältige Fragmentierungstechniken wie „collision-induced dissociation“ (CID), „higher-energy C-trap dissociation“ (HCD) und „electron-transfer dissociation“ (ETD). Durch den Einsatz dieses hochauflösenden Quadrupole, Ionenfallen-Orbitrap Massenspektrometers können komplexe biologische Proben in Tiefe analysiert werden. Neben der Standardkonfiguration mit einer Hochleistungsflüssigkeitschromatographie wurde ein weiteres Flüssigkeitschromatographie System, das vor allem für Projekte mit hohen Probendurchsatz und kurzen Gradienten konzipiert wurde, beantragt. Diese zusätzliche Chromatographie Einheit wird eine wichtige Rolle bei der Etablierung der Systemmedizin in Köln spielen. Das beantragte Massenspektrometer erlaubt ferner die Fragmentierung von intakten Proteinen über ETD. Diese Methode ist an der Universität zu Köln bisher nicht durchführbar ist. Die Kombination aus verschiedenen Fragmentierungsarten (CID, ETD) bietet ferner eine optimale Darstellung von vernetzten Peptiden die durch spaltbare „cross-linker“ Moleküle vernetzt wurden. In enger Zusammenarbeit mit der Abteilung von Prof. Schwarz und Prof. Behrmann soll hier die Struktur von Proteinkomplexen mittels „cross-linking“ Massenspektrometrie (XL-MS) und Kryo-Elektronenmikroskopie genauer untersucht werden. CID Fragmentierungen werden mit einem Ionenfallen-Massenspektrometer (Anschaffung 2008) durchgeführt, was nicht mehr dem Stand der Technik entspricht. Insgesamt wird das beantragte Massenspektrometer die Kapazität der Facility erhöhen und das Methodenspektrum deutlich erweitern.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Hybrid-Massenspektrometer mit einem Gradienten Fokussierungssystem für die Flüssigkeitschromatographie
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Universität zu Köln
• Leiter: Professor Dr. Marcus Krüger