Einzelzell RNA- Sequenzierungen von humanen Nierenbiopsien für die Präzisionsmedizin in der Nephrologie

• Antragsteller: Professor Dr. Rafael Kramann; Professor Dr.-Ing. Julio Saez-Rodriguez; Professor Dr. Oliver Stegle, Ph.D.
• Fachliche Zuordnung: Nephrologie
• Förderung: Förderung von 2020 bis 2022
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 433151787

Die chronische Niereninsuffizienz betrifft bereits mehr als 10% der Bevölkerung in Deutschland. Allerdings fehlen bis heute spezifische Therapien und prognostische Biomarker im Erkrankungspektrum der zu chronischer Niereninsuffizienz und terminaler Niereninsuffizienz beitragenden renalen Erkrankungen. Im Projekt CKD-Seq werden wir Einzelzell RNA-Sequenzierungen sowie Einzelzell ATAC-Sequenzierungen von Nierenbiopsien von 10 renalen Erkrankungen (häufige und seltene) durchführen. Lebend Nierenspender Biopsien werden als Kontrolle untersucht. Ziel ist es insgesamt 10.000 Zellen von jeweils 20 Biopsien jeder Erkrankung zu Sequenzieren. Die Erkrankungen sind so ausgesucht das wir die Mehrzahl der zu CKD beitragenden Erkrankungen abdecken. Für alle der insgesamt 200 Biopsien haben wir mindestens 5 Jahre klinische Follow-up Daten bezüglich Nierenfunktionsverschlechterung und wir werden jeweils 10 Biopsien jeder Erkrankung mit Funktionsverlust und 10 mit stabiler Nierenfunktion im 5 Jahres Verlauf nach Biopsie einschließen. Durch neue Strategien die es ermöglichen individuelle Patientenproben zusammen zu analysieren ist eine Analyse von insgesamt 2 Millionen Nierenzellen von 200 Patienten möglich. Ziel ist es neue prognostische und diagnostische Marker zu identifizieren und auch neue potentielle therapeutische Targets. Dies soll durch neuartige Systemmedizinische Analysen ermöglicht werden. Das Interdisziplinäre Projekt ist durch eine Enge Kollaboration von klinischen Nephrologen owie Molekularbiologen und Systembiologen sowie Bioinformatikern entstanden. Es ist nur über eine Enge Kollaboration mit Nutzun der Ressourcen in DFG Sequenzier-Zentren möglich.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen