Hochdurchsatz-Genotypisierungssystem

• Fachliche Zuordnung: Agrar-, Forstwissenschaften und Tiermedizin
• Förderung: Förderung in 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 437098084

Die Charakterisierung von Einzelnukleotidpolymorphismen (Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs) in Kandidatengenen ist eine Standardmethode zur Untersuchung adaptiver genetischer Variation in der ökologischen Genetik und Züchtung. Um zu verstehen wie sich Tier- und Pflanzenpopulationen an sich ändernde Umweltbedingungen angesichts des Klimawandels anpassen, ist die Untersuchung genetischer Variation in Schlüsselgenen entlang von Umweltgradienten notwendig. Zusätzlich zur genetischen Variation ermöglichen anscheinend epigenetische Faktoren eine schnelle und plastische Reaktion auf sich ändernde Umweltbedingungen und erleichtern somit die langfristige evolutionäre Anpassung. Für hochrangige Publikationen in Fachzeitschriften sind großräumige Untersuchungen genetischer und epigenetischer Variation notwendig. Die Massenspektrometrie zur genauen Messung von Amplicons aus der PCR ist ein Standardverfahren für die gezielte Untersuchung von genetischen und epigenetischen Markern. Es ermöglicht die kostengünstige Analyse genetischer und epigenetischer Variation und deren Rolle bei der lokalen Anpassung von natürlichen und Züchtungspopulationen. Speziell könnten wir Assays für eine Vielzahl von Pflanzen-und Tierarten entwickelt werden, um genetische/epigenetische Variationsmuster und deren Assoziation mit Umweltvariablen zu untersuchen. Die Anwendung des Systems durch unterschiedliche Abteilungen der Fachbereiche Forst, Biologie und Landwirtschaft und innerhalb des Center of Integrated Breeding Research der Universität Göttingen würde die interdisziplinäre Zusammenarbeit innerhalb der Universität weiter fördern.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Hochdurchsatz-Genotypisierungssystem
• Gerätegruppe: 3150 DNA-Sequenzer
• Antragstellende Institution: Georg-August-Universität Göttingen
• Leiter: Professor Dr. Oliver Gailing