Protonenpermeation und Ionenselektivität von Viroporinen untersucht mittels atomistischer Molekulardynamiksimulationen (C08*)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 221545957

Innerhalb dieses Projekts soll als Hauptziel ein umfassendes Verständnis der Protonen- und Kationenpermeation durch die biomedizinisch relevanten Viroporinen, wie z. B. den M-Proteinen des Dengue- und West-Nil-Virus, gewonnen werden. Mit Hilfe von atomistischen Moleküldynamik-Simulationen sollen Protonen- und Kationentransportwege identifiziert werden, während quantenmechanische und molekularmechanische Rechnungen dazu dienen, die Dynamik von protonierungsgekoppelter Permeation auf atomarer Ebene zu erfassen. Zudem sollen durch MD-Simulationen unter konstantem pH Protonierungs-zustände von titrierbaren Gruppen bestimmt werden.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1078: Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik
• Antragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiterin: Professorin Dr. Han Sun