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Cytolabs Projekt: Entdeckung und breite biologische Charakterisuerung neuer Cytochalasane und Aufbau einer Cytochalasan-Substanzbibliothek
Antragsteller
Professor Dr. Marc Stadler
Fachliche Zuordnung
Biologische und Biomimetische Chemie
Organismische Interaktionen, chemische Ökologie und Mikrobiome pflanzlicher Systeme
Organismische Interaktionen, chemische Ökologie und Mikrobiome pflanzlicher Systeme
Förderung
Förderung seit 2021
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 438841444
Unsere früheren Arbeiten stellten einen wichtigen Ausgangspunkt für die Initiierung der aktuellen Forschergruppe dar, da wir kürzlich zahlreiche Cytochalasane aus Fruchtkörpern und Kulturen von Pilzarten isoliert und charakterisiert haben, von denen die meisten zu den Xylariales und anderen Ordnungen der Klasse Sordariomycetes gehören. Ihre biologischen Aktivitäten und ihre Biosynthese wurden bereits mit anderen Mitgliedern des Cytolabs-Konsortiums bewertet, was zu mehreren gemeinsamen Veröffentlichungen führte. In der vorgeschlagenen Forschergruppe werden wir weiterhin eng mit allen Projektpartnern zusammenarbeiten.Die Rolle unseres Teilprojekts wird darin bestehen, weitere natürliche Cytochalasane mithilfe präparativer HPLC- und Spektralmethoden (NMR, MS) zu isolieren und zu identifizieren und sie einer umfassenden Bewertung ihrer biologischen Aktivitäten unter Verwendung etablierter biologischen Tests zur Bestimmung von antimikrobiellen Wirkstoffen (einschließlich Anti-Biofilm), nematizide und zytotoxische Wirkungen, zu unterziehen. Verbindungen aus anderen Teilprojekten, einschließlich synthetischer und halbsynthetischer Derivate, werden in diesen Workflow aufgenommen. Andererseits werden besonders interessante Varianten dieser Verbindungsklasse biotechnologisch in ausreichenden Mengen für die Semisynthese und für eingehende Untersuchungen ihrer Wirkungsweise in biologischen Systemen unter Verwendung der internen Fermentations- und Aufarbeitungsanlagen hergestellt, die die Produktion von Naturstoffen bis hin zum Multi-Gramm Maßstab erlauben. Die Scale-up-Verfahren werden sowohl mit Wildtyp-Stämmen durchgeführt, die aus unseren laufenden Kooperationen stammen, an denen Wissenschaftler aus der ganzen Welt beteiligt sind, als auch mit heterologen Produktionsstämmen und Mutanten, die von der Cox-Gruppe bereitgestellt werden. Parallel dazu werden in unserem Labor eine Substanzbibliothek und eine entsprechende Datenbank erstellt, um einen guten Überblick über die biologischen Aktivitäten zu erhalten, und wir werden Verbindungen innerhalb des Konsortiums und an externe Partner verteilen. Diese Arbeiten können auf einer bereits vorhandenen HPLC-DAD / MS- Dereplikationsbibliothek aufbauen, zu der im Verlauf des Projekts alle Ergebnisse zu Bioaktivität, Taxonomie der Produzentenstämme und anderen wichtigen Informationen hinzugefügt werden.
DFG-Verfahren
Forschungsgruppen