Charakterisierung des genetischen Einflusses auf die interindividuelle Variabilität der Immunantwort im Menschen

• Antragstellerin: Dr. Sarah Kim-Hellmuth
• Fachliche Zuordnung: Humangenetik ; Immunologie ; Medizininformatik und medizinische Bioinformatik
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 459153572

Das menschliche Immunsystem spielt eine Schlüsselrolle in der Abwehr eindringender Keime, aber auch bei Autoimmun-, Krebs- und Stoffwechselerkrankungen sowie in Alterungsprozessen. Genomweite Assoziationsstudien dieser Erkrankungen haben Hunderte von genetischen Loci in Genen des Immunsystems identifiziert und deuten somit auch auf eine zentrale mechanistische Beteiligung des Immunsystems hin. Für die überwiegende Mehrheit dieser genetischen Varianten ist der Wirkmechanismus und die, bisher wenig untersuchte, jedoch offensichtlich entscheidende, Kontextabhängigkeit unbekannt. Diese zentralen Fragestellungen werden durch das hier vorgeschlagene Forschungsvorhaben bearbeitet. Das übergeordnete Ziel ist die Charakterisierung des genetischen Einflusses auf die menschliche Immunantwort, um unser Verständnis von krankheitsassoziierten Varianten zu verbessern und Fragen der Plastizität der Genomfunktion zu beantworten. Zu diesem Zweck werden wir zunächst die in vivo transkriptionelle Immunantwort mit long-read cDNA-Sequenzierung in einer Kohorte von 250 umfassend charakterisierten Teilnehmern einer Gelbfieber-Impfstudie untersuchen. Die Integration der Transkriptom-Daten mit den genetischen und systemimmunologischen Daten, die für diese Kohorte bereits zur Verfügung stehen, bietet eine einzigartige Grundlage, eine detaillierte Kartierung des genetischen Einflusses auf die Immunantwort zu erstellen. Dieser Ansatz soll als Blaupause dienen für die Aufarbeitung von Krankheitsassoziationen und stellt den Übergang dar von der genetischen Entdeckung hin zur funktionellen Interpretation, die letztendlich die klinische Anwendung ermöglichen wird.

• DFG-Verfahren: Emmy Noether-Nachwuchsgruppen