Charakterisierung neuer telomer-bindender Proteine in C. elegans

• Antragsteller: Dr. Falk Butter
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 491577942

Telomere, die Enden linearer Chromosomen bestehen meist aus repetitiven doppel- und einzelsträngigen DNA-Sequenzen. Telomere werden durch spezielle Proteinkomplexe, wie Shelterin gebunden, die Telomere vor der DNA-Schadensreparatur schützen und in dem Erhalt der Telomerintegrität während Zellteilungen assistieren. Zurzeit gibt es jedoch noch kein vollständiges Bild der Proteine, die mit Telomeren im populären Modellorganismus C. elegans interagieren. Wir haben mit Hilfe eines quantitativen Proteomexperimentes Proteine gesucht, die an Telomere in C. elegans binden und die beiden Paraloge TEBP-1 und TEBP-2 als Bindeproteine in vitro und in vivo charakterisiert. TEBP-1 und TEBP-2 bilden einen telomerischen Komplex mit den bekannten Einzelstrangbindeproteinen POT-1, POT-2 und MRT-1. Unsere Ergebnisse zeigen erstmalig, das in C. elegans ein telomerbindender Komplex existiert. Interessanterweise haben TEBP-1 und TEBP-2, beide doppelstrangbindende Proteine, unterschiedliche Telomerlängenphänotypen. Innerhalb dieses Projektes wollen wir die Organisation und Funktion des von uns neu beschriebenen Telomerkomplexes in C. elegans mit molekularbiologischen und biochemischen Methoden weiter untersuchen. Studien zur Architektur des Komplexes in vitro werden dabei von funktionalen Studien mit Mutanten in vivo komplementiert. Zusätzlich werden wir die weiteren Kandidaten aus unserem Proteomexperiment auf ihre Funktion am Telomer analysieren.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen