Hochauflösendes Tandem-Massenspektrometer mit Flüssigkeitschromatographie (UHPLC-QTOF-MS)

• Fachliche Zuordnung: Pflanzenwissenschaften
• Förderung: Förderung in 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 495720893

Das beantragte hochauflösende Hybrid-Massenspektrometer stellt eine Ersatzbeschaffung für das vorhandene UHPLC-QTOF-MS-System zur ungerichteten Metabolom-Analyse, dem sogenannten metabolite fingerprinting, dar. Das Gerät wird zentral durch die Serviceeinheit Metabolom- und Lipidom-Analytik von der Abteilung Biochemie der Pflanze am Göttinger Zentrum für Molekulare Biowissenschaften (GZMB) betrieben. Die Serviceeinheit bietet den Abteilungen des GZMBs, der Georg-August-Universität, aber auch externen akademischen Kooperationspartnern eine umfassende Infrastruktur für die Analyse von kleinen Molekülen und hält dafür gerichtete und ungerichtete Ansätze vor. Die ungerichtete Metabolom-Analyse vermittelt einen umfassenden Blick auf den metabolischen Zustand eines Organismus nach biotischem oder abiotischem Stress oder in Folge von genetischen oder entwicklungsbedingten Veränderungen. Dabei erlaubt das metabolite fingerprinting durch die große Tiefenschärfe der Analysen die Identifizierung und Charakterisierung von metabolischen Markern bzw. Stoffwechselwegen, die in funktionellem Zusammenhang mit den entsprechenden Einflussfaktoren stehen. Die Resultate der ungerichteten Metabolom-Analyse haben sich auch als sehr wertvoll für das Generieren von Arbeitshypothesen und die Entwicklung neuer wissenschaftlicher Fragestellungen erwiesen. Das beantragte hochauflösende Hybrid-Massenspektrometer soll auch zur Weiterentwicklung unseres ex vivo-Metabolomics-Ansatzes für die funktionelle Annotation von Enzymen genutzt werden. Dieser hypothesenfreie Ansatz kombiniert Proteinbiochemie und metabolite fingerprinting, um Substrat-Produkt-Paare für nicht charakterisierte Enzyme zu identifizieren und damit deren physiologische Funktionen zu beschreiben. Zusätzlich planen wir, mit dem neuen UHPLC-QTOF-MS-System unsere Expertise zur Lipidom-Analyse zu erweitern, indem wir eine Plattform zur ungerichteten Lipidom-Analyse etablieren. Diese soll die bereits existierende Methode für gerichtete Analysen vervollständigen und die Identifizierung bisher unbekannter Lipidmarker ermöglichen.Die Ersatzbeschaffung des UHPLC-QTOF-MS-System wird es uns ermöglichen, anspruchsvolle Methoden zur ungerichteten Metabolom- und Lipidom-Analyse weiterzuentwickeln und diese der wissenschaftlichen Gemeinschaft zur Verfügung zu stellen.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Hochauflösendes Tandem-Massenspektrometer mit Flüssigkeitschromatographie (UHPLC-QTOF-MS)
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Georg-August-Universität Göttingen
• Leiter: Professor Dr. Ivo Feußner