Next-Generation-Sequencing von Laser-mikropräparierten Einzelzellen der Langehans-Inseln von metabolisch phänotypisierten Lebend-Spendern

• Antragsteller: Professor Michele Solimena
• Fachliche Zuordnung: Endokrinologie, Diabetologie, Metabolismus
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 514060695

Metabolisch phänotypisierte pankreatektomierte Patienten, welche als Lebend-Spender oder auch Donatoren (LD) bezeichnet werden, sind eine neuartige und reproduzierbare Quelle für Pankreasinseln für die Forschung. Da die konventionelle enzymatische Isolierung von Inseln deren Genexpression verändern kann, gewinnen wir routinemäßig Proben von höchster Qualität für Transkriptomanalysen durch Laser-Capture-Mikrodissektion (LCM) aus tiefgefrorenen chirurgisch gewonnenen Geweben in unserer Biobank, die die weltweit größte ihrer Art ist. Aufbauend auf unseren früheren NGS-Transkriptom- und Proteom-Analysen an LCM-gewonnenen Inseln, schlagen wir hier vor, die Genexpression in einzelnen LCM-gewonnenen Inselzellen von LD mit Normoglykämie (10), beeinträchtigter Glukosetoleranz (10) oder Typ-2-Diabetes (10) mit einem zieloffenen Ansatz zu profilieren. Dies soll es uns ermöglichen, den Zelltyp eindeutig zu identifizieren, von dem die Veränderungen in der Genexpression stammen, die bei der NGS-Analyse von Inselzellen gefunden wurden und die mit der fortschreitenden Verschlechterung der Hyperglykämie korrelieren. Die gewonnenen Daten werden mit anderen Datensätzen aus diesen LD kombiniert, einschließlich klinischer Daten, Proteomik von LCM-gewonnenen Gesamtinseln und einzelnen Inselzellen (in Arbeit) sowie Shotgun-Lipidomik von LCM-gewonnenen Gesamtinseln und Plasmaproben. Durch die Durchführung dieses ehrgeizigen, beispiellosen Projekts soll ein neuartiger Atlas der Genexpression in Inselzelltypen in situ entlang des Kontinuums von Gesundheit bis T2D entstehen und das geplante Projekt somit eine Referenzstudie auf diesem Gebiet darstellen.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen