UbiBodies - Eine neue Generation von spezifischen und vielseitigen Einzeldomänenantikörpern gegen Ubiquitinketten

• Antragsteller: Julian Koch
• Fachliche Zuordnung: Biochemie ; Zellbiologie
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 521996691

Ubiquitinierung, die Modifikation von Zielproteinen mit dem 8,6 kDa grossen Protein Ubiquitin (Ub), ist mittlerweile als eine der umfangreichsten und komplexesten Signalwege in eukaryotischen Zellen bekannt. Ub ist an fast allen wichtigen biologischen Vorgängen in der Zelle beteiligt. Es ist in acht Typen von unterschiedlich verknüpften Ubiquitinketten aufgeteilt, die enzymatisch an die Zielmoleküle angebracht werden. Leider wissen wir immer noch sehr wenig über die zellulären Funktionen von den sechs Kettentypen, die als "atypische" Ubiquitinketten bekannt sind. Das liegt vor allem an einem Mangel an Reagenzien, die in der Lage sind, diese Ub-Ketten spezifisch zu binden und sichtbar zu machen. Somit ist das Ziel des Vorhabens die Entwicklung einer neuen Generation von Einzeldomänenantikörpern (sdAbs) um bis dato unbekannte biologische Vorgänge sichtbar zu machen, die von atypischen Ub-Ketten reguliert werden. Für die in vitro-Selektion der sdAbs mit Hilfe der Phagen-Display-Technik kommen dabei unsere extrem umfangreichen und vielseitigen Phagen-Bibliotheken zum Einsatz. Im Rahmen des Projekts planen wir, mit dem für uns am wichtigsten atypischen Ubiquitin, M1-Ub, zu starten. Gleichzeitig wollen wir die Methodik so allgemein wie möglich halten, um die Option zu haben, unsere Technik in Zukunft ebenfalls auf die übrigen atypischen Ub-Ketten auszuweiten. Unsere resultierenden spezifischen sdAb gegen die Ub-Ketten, genannt 'UbiBodies', werden dann für die Detektion, Anreicherung und funktionelle zelluläre Analyse der Ub-Kettentypen getestet und genutzt. Unsere UbiBodies stellen somit eine neue Generation von Reagenzien zur Erforschung der atypischen Ub-Ketten dar, mit einem enormen Potential für die Entdeckung von bis dato unbekannten zellulären Funktionen der atypischen Ub-Ketten.

• DFG-Verfahren: WBP Stipendium
• Internationaler Bezug: Dänemark
• Gastgeber: Professor Rune Busk Damgaard, Ph.D.