N-Dimensionale Trennung zur Charakterisierung von Proteomen

• Applicant: Professor Dr. Anton Horn (†)
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2000 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5230036

In der Arbeitsgruppe I soll ein neues Verfahren zur Proteomcharakterisierung (1) erprobt werden, welches die mehrdimensionale Analyse von Proteomen erlaubt. Dazu werden die Proteine des Proteoms unter standardisierten Bedingungen einer Vielzahl von n größer 2 Trennverfahren derart unterworfen, daß jeweils jede der in einem Trennschritt enthaltenen m1 Fraktionen in einem darauffolgenden Trennschritt m2 Fraktionen liefert, so daß am Ende m1 x m2 ...x mn = M Fraktionen in wässriger Lösung vorliegen, die durch Identifikatoren, Quantifikatoren und die Lage im n-dimensionalen Analysenraum charakterisiert sind. Als eine Methode der Identifikation und Quantifikation soll die hochauflösende Massenanalyse mit einem Q-Tof Hybridmassenspektrometer im off- und online Einsatz nach Proteaseverdau zum Erhalt eines Peptide Mass Fingerprints bzw. eines Sequence tags der Peptide sowie der Aufklärung von Modifikationen nach Fragmentierung eingesetzt werden.

• DFG Programme: Research Grants
• Major Instrumentation: ESI-Q-Tof-Hybridmassenspektrometers
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Participating Persons: Professor Dr. Stefan H. Heinemann; Professor Dr. Reinhard Predel; Professor Dr. Siegmund Reißmann