DNA-Array-Plattform

• Fachliche Zuordnung: Mikrobiologie, Virologie und Immunologie
• Förderung: Förderung in 2007
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 52302339

Ich beantrage eine DNA-Array-Plattform, welche die Herstellung und Auswertung von cDNA-Arrays in unterschiedlichsten Formaten (Glas-Objektträger, Nylonmembranen bis zu Mikrotiterpiatten) und Spotdichten (Makro- bis Mikroarray-Formate) erlaubt, so dass Genexpressionsereignisse in verschiedenen Modellsystemen untersucht werden können. Dazu wird eine Kombination aus kontaktlosem Array-Spotter und Mikroarray-Scanner benötigt, die neben flexiblen Array-Formaten auch einen hohen Durchsatz an Proben erreichen, da diese Funktionseinheit durch eine Vielzahl von Kollegen mit unterschiedlichsten Fragestellungen genutzt werden soll. Essentielles Zubehör in einem multi-user Umfeld sind ein Mikrotiterplatten-Waschgerät und eine semi-automatische Hybridisierstation für hohen Probendurchsatz sowie eine 96-well-Multiblock PCR-Station und ein Nanodrop-Spektralanalyser. Zur Validierung der cDNA-Array-basierten Genexpressionsanalysen wird zusätzlich ein Real-Time PCR Geräte benötigt. Erst diese Komplettausstattung der Funktionseinheit ermöglicht die flexible Herstellung, Auswertung und die Validierung von cDNAArrays unterschiedlicher Formate, die meiner Arbeitsgruppe bisher in Konstanz nicht zur Verfügung steht.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Gerätegruppe: 3170 DNA-Array-Systeme
• Antragstellende Institution: Universität Konstanz
• Leiter: Professor Dr. Christof Robert Hauck