Lineares Ionenfallen Massenspektrometer
Final Report Abstract
Ein zentraler Arbeitsschwerpunkt am Institut für Funktionelle Genomik der Universität Regensburg ist die Entwicklung und Anwendung analytischer Methoden für metabolomische Untersuchungen, welche für eine Vielzahl biomedizinischer Fragestellung von großer Relevanz sind. Das 4000 QTRAP LC-MS/MS System wird vorwiegend für diese Untersuchungen genutzt. So wurden nachweisstarke quantitative Methoden zur Bestimmung von Aminosäuren basierend auf iTRAQ oder Derivatisierung mit Propylchloroformat, RP-HPLC Trennung, Elektrosprayionisierung und Detektion im MRM Modus entwickelt. Ferner wurde eine Methode zur Bestimmung von Metaboliten des Methionin- und Polyaminstoffwechsels entwickelt um die metabolischen Konsequenzen eines Verlustes der Expression der Methylthioadenosin-Phosphorylase (MTAP) in Tumoren und bei der nichtalkoholischen Steatohepatitis zu untersuchen. Unter Verwendung stabiler isotopenmarkierter Substrate wird die Aktivität ausgewählter Schlüsselenzyme, wie z.B. MTAP und Ornithindecarboxylase (ODC) bestimmt. Es wurde weiterhin eine nachweisstarke Methode zur Bestimmung von Tryptophanabbauprodukten entlang des Kynurenin-Stoffwechselweges entwickelt, die zur Untersuchung von immunregulatorischen Mechanismen bei der Graftversus-Host-Krankheit (GvHD) eingesetzt wird. Schließlich wurde eine Methode für die Analyse von Intermediaten des zentralen Kohlenstoffwechsels implementiert, die auch für metabolische Flussanalysen unter Verwendung stabiler Isotopen markierter Substrate verwendet wird. Mit dieser Methode wurde eine Inhibition der Glykolyse in Monozyten durch Milchsäure, die von Tumoren freigesetzt wird, gezeigt, welches zum Immune Escape von Tumoren beiträgt.
Publications
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Stevens, Dettmer, Kirovski, Samejima, Hellerbrand, Bosserhoff, Oefner
- Deficient tryptophan catabolism along the kynurenine pathway reveals that the epididymis is in a unique tolerogenic state. (2011) J Biol Chem 286:8030
Jrad-Lamine, Henry-Berger, Gourbeyre, Damon-Soubeyrand, Lenoir, Combaret, Saez, Kocer, Tone, Fuchs, Zhu, Oefner, Munn, Mellor, Gharbi, Cadet, Aitken, Drevet
- Down-regulation of methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) induces progression of hepatocellular carcinoma via accumulation of 5'-deoxy-5'- methylthioadenosine (MTA). (2011) Am J Pathol 178:1145
Kirovski, Stevens, Czech, Dettmer, Weiss, Wild, Hartmann, Bosserhoff, Oefner, Hellerbrand
