Erzeugung von DNA-Mikrorastern für zwei halophilen Archaea und ihre Anwendung für globale Regulationsuntersuchungen

• Antragsteller: Professor Dr. Jörg Soppa
• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung von 2000 bis 2003
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5230464

In den letzten Jahren wurden DNA-Mikroraster (DNA-Chips, Microarrays) entwickelt und mit überragendem Erfolg in globale Regulationsstudien mit eukaryontischen Modellorganismen eingesetzt. Die fast fertiggestellte Genomsequenzierung wird die Entwicklung eines DNA-Mikrorasters für Halobacterium salinarum erlauben, ein intensiv untersuchter Modellorganismus für Archaea. Mit den DNA-Mikrorastern werden die Änderungen der Transkriptmengen aller Gene z.B. bei Wechsel der Energiesubstrate, im Verlauf des Zellzyklus oder beim Übergang in die stationäre Phase verfolgt werden. Die Messung aller Transkriptionsänderungen in gezielt erzeugten Regulatormutanten wird die Aufklärung von Relgulationshierachien und -netzwerken ermöglichen. Die Ergebnisse der Transkriptomanalysen werden mit parallel stattfindenden Proteomanalysen verglichen werden, und ausgewählte Transkripte werden genauer untersucht werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen
• Großgeräte: DNA-Mikroarray-System (Komplettsystem der Firma GMS)
• Gerätegruppe: 3170 DNA-Array-Systeme
• Beteiligte Person: Professor Dr. Dieter Oesterhelt (†)