Nukleäre tRNA3` Prozessierung in Höheren Pflanzen

• Antragstellerin: Professorin Dr. Anita Marchfelder
• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen
• Förderung: Förderung von 2000 bis 2010
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5239266

• Erstellungsjahr: 2010

Zusammenfassung der Projektergebnisse

Die Arbeiten in dem Projekt haben sich mit dem tRNA 3´ prozessierenden Enzym, der tRNase Z, aus Arabidopsis thaliana beschäftigt. In A. thaliana gibt es vier tRNase Z Enzyme, zwei kurze Formen und vier lange Formen, und Arabidopsis ist der einzige Organismus, in dem bisher so viele tRNase Z Enzyme gefunden wurden. In der letzten Förderperiode dieses Projektes waren für die Untersuchungen zwei Schwerpunkte gesetzt worden: 1. die Aufklärung der biologischen Funktion der kurzen tRNase Z Enzyme in Arabidopsis mithilfe transgener Pflanzen, 2. die biochemische Charakterisierung der kurzen tRNase Z Enzyme. Im Laufe des Projektes haben wir uns entschlossen nicht nur die zwei kurzen tRNase Z Proteine, sondern alle vier in Arabidopsis vorhandenen Proteine zu untersuchen. Wir konnten für drei der vier tRNase Z Gene homozygote T-DNA-Linien etablieren. Die T-DNA Linie des vierten tRNase Z Gens stellte sich als embryo-lethal heraus. Für alle vier tRNase Z Proteine konnten GFP-Fusionsproteine hergestellt werden, die die Lokalisation der Proteine in der Zelle sauber dokumentierten. Außerdem konnten wir die kurze tRNase Z eingehend biochemisch charakterisieren.

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

• (2005) Analysis of the functional modules of the tRNA 3' endonuclease (tRNase Z). J Biol Chem 280(42): 35440-35447
  Späth B, Kirchner S, Vogel A, Schubert S, Meinlschmidt P, Aymanns S, Nezzar J, Marchfelder A
  
• (2005) The tRNase Z family of proteins: physiological functions, substrate specificity and structural properties. Biol Chem 386: 1253-1264
  Vogel A, Schilling O, Späth B, Marchfelder A
  
• (2005) The tRNase Z-enzyme family: in vivo- and in vitro-studies. PhD Thesis, Biology II, Ulm University, Ulm
  Späth B
  
• (2007) Metal Requirements and Phosphodiesterase Activity of tRNase Z Enzymes. Biochemistry 46: 14742-14750
  Späth B, Settele F, Schilling O, D'Angelo I, Vogel A, Feldmann I, Meyer-Klaucke W, Marchfelder A
  
• (2007) tRNase Z: the end is not in sight. Cell Mol Life Sci 64(18): 2404-2412
  Späth B, Canino G, Marchfelder A
  
• (2009) Arabidopsis Encodes Four tRNase Z Enzymes. Plant Physiol 150(3): 1494-1502. Epub 2009 May 1491
  Canino G, Bocian E, Barbezier N, Echeverria M, Forner J, Binder S, Marchfelder A
  
• (2009) Processing of a Dicistronic tRNA-snoRNA Precursor: Combined Analysis in Vitro and in Vivo Reveals Alternate Pathways and Coupling to Assembly of snoRNP. Plant Physiol 150(3): 1598-1610. Epub 2009 May 1596
  Barbezier N, Canino G, Rodor J, Jobet E, Saez-Vasquez J, Marchfelder A, Echeverria M