Transkriptomanalyse von Lotus japonicus in der arbuskulären Mykorrhiza

• Applicant: Dr. Catherine Kistner
• Subject Area: Plant Genetics and Genomics
• Term: from 2000 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5245260

Ziel des Projektes ist die genomweite Analyse des Genexpressionsmusters (oder Transkriptoms) in Wurzeln der Modellleguminose Lotus japonicus in der Ausbildung arbuskulärer Mykorrhiza. Die Sequenzanalyse induzierter cDNAs soll einen umfassenden Überblick über die strukturellen Veränderungen und komplexen Anpassungen im Stoffwechsel der mykorrhizierten Wurzeln geben. Die vergleichende Analyse der Wurzelknöllchensymbiose soll funktionelle Gemeinsamkeiten aufzeigen. Mit Hilfe einer Kollektion von Lotus-Mutanten, die Defekte in verschiedenen Symbiosestadien aufweisen, und zeitlich aufgelöster Expressionsanalytik sollen Gene definierten funktionellen Hierarchiestufen zugeordnet werden. In Anbindung an das Zentralprojekt des SPP "Mykorrhiza" sollen die Gene bestimmt werden, die sowohl in Lotus japonicus als auch in medicago truncatula AM-reguliert exprimiert sind. Diese Schnittmenge sollte für die symbiotische Interaktion funktionell bedeutsame Gene enthalten. Eine Auswahl der identifizierten Gene soll in Zusammenarbeit mit mehreren am SPP "Mykorrhiza" beteiligten Arbeitsgruppen funktionell charakterisiert werden.

• DFG Programme: Priority Programmes
• Subproject of: SPP 1084: Molecular Basics of Mycorrhizal Symbioses
• International Connection: United Kingdom
• Participating Person: Professor Dr. Martin Parniske