Entwicklung eines Oligonukleotid-Mikrochips mit erhöhter Sensitivität zur DNA Analyse

• Applicant: Dr. Christel Adomat
• Subject Area: Plant Biochemistry and Biophysics
• Term: from 2000 to 2002
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5248428

Durch die parallele Immobilisierung von Detektionsprimern und Reporter-Fluoreszenzfarbstoff auf einem Mikrochip soll das Hybridisierungssignal von Targetgenen bei deren Sequenzanalyse nach dem APEX Konzept vervielfältigt werden. In den Detektionsprimer soll dabei als Konsequenz der Hybridisierung mit dem Targetgen Malachitgrün eingebaut werden, welches bei Belichtung Hydroxyradikale bildet. Die Radikale sollen die Fluoreszenz des Reporterfarbstoffes aktivieren. Auf diese Weise lassen sich durch die Hybridisierung eines Targetmoleküls mehrere Moleküle des Farbstoffes zur Fluoreszenz anregen. Der entwickelte Chip soll bei der Analyse von Mutationen in dem Tumor-Supressor-Gen p53 getestet werden. Dabei sollen DNA-Proben von Patienten ohne vorherige Amplifikation des p53-Gens verwendet werden. Eine solche Amplifikation des Targetgens ist bisher bei der DNA-Analyse nach dem APEX Konzept notwendig.

• DFG Programme: Research Fellowships
• International Connection: USA
• Cooperation Partner: Professor Dr. Michael C. Pirrung