Molekulare Charakterisierung des Resistenzgens RPB1 von Arabidopsis thaliana gegen Plasmodiophora brassicae

• Antragstellerin: Professorin Dr. Maria Dolores Sacristán (†)
• Fachliche Zuordnung: Biochemie und Biophysik der Pflanzen
• Förderung: Förderung von 1996 bis 2002
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5259120

Für die Studien zur molekularen Identifizierung eines Resistenzgens gegen die Kohlhernie wurde von uns das Modellsystem Arabidopsis thaliana verwendet. Der Ökotyp Tsu-0 von Arabidopsis zeigte nach Infektion mit einem Isolat von Plasmodiophora brassicae eine Resistenzreaktionen und wurde von uns für weitere Analysen verwendet. Die RPB1-Region auf Chromosom 1 konnte durch Analyse mit RFLP-Markern sowie durch Kartierung von isolierten YAC- und BAC-Insertenden physikalisch definiert werden. Nach der Etablierung eines YAC-Contigs wurde der RFLP-Marker rpHS-1, mit dem noch 3 rekombinante Pflanzen (3 von 2008 untersuchten Pflanzen) rechts vom Genlocus erkannt werden, als Startpunkt für den "chromosomal walk" mit BAC-Klonen verwendet. Es konnte von uns durch Kartierungs- und PCR-Experimente eine BAC-Contig über die RPB1-Region erstellt werden. Aufgrund mangelnder Auflösung unserer Kartierungspopulation links vom Gen muß mit Hilfe zweier sicher lokalisierter BACs, BAC033 und BAC029, ein Cosmid-Contig über den RPB1-Bereich erstellt werden. Gegenstand des vorliegenden 2. Verlängerungsantrags sind Transformationsexperimente mit den isolierten binären Cosmiden in den anfälligen Ökotyp Cvi-O zur Eingrenzung des Bereiches um das RPB1 Gen auf Cosmidgröße, die Identifizierung des Gens und seine erste Charakterisierung.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen