Identification of disease associated genetic variants on chromosome 6p in inflammatory bowel disease

• Antragsteller: Professor Dr. Stefan Schreiber
• Fachliche Zuordnung: Humangenetik
• Förderung: Förderung von 2001 bis 2007
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5467992

Chronisch entzündliche Darmerkrankungen (M. Crohn, Colitis ulcerosa) treten mit einer Prävalenz von ca. 0.5% in den westlichen Industrienationen auf. Die schubweise verlaufenden Erkrankungen zeigen in ca. 10% der Fälle eine familiäre Häufung (lamba(S): 15-50). In einer genomweiten Suche wurden in unserer Population an über 400 erkrankten Geschwisterpaaren Kopplungsregionen auf den Chromosomen 16 ("IBD1")und 12 ("IBD2") bestätigt und auf Chromosom 6 ("IBD3") neu etabliert. Auf Chromosom 6 sollen ein Raster von Einzelbasenpolymorphismen in engem genomischen Abstand mit hohem Durchsatz durch allelspezifische PCR (TaqMan-Technik) in Patienten und gesunden Eltern typisiert werden. Eine entsprechende Typisierungsplattform besteht im Q-Bereich der Forschergruppe. Zusätzlich werden Einzelbasenpolymorphismen in pathophysiologischen Kandidatengenen aus der Region systematisch untersucht. Wichtige Hinweise auf neue, pathophysiologisch wichtige Gene ergeben sich aus der Interaktion mit dem Projekt (Lengauer/Zimmer). Durch die systematische Typisierung sollen Kopplungsungleichgewichte als Hinweis auf eine krankheitsveranlagende Mutation gefunden werden. Die verursachende(n) Mutation(en) soll(en) positionell identifiziert werden.

• DFG-Verfahren: Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: FOR 423: Genetische Epidemiologie und Medizinische Genetik komplexer Erkrankungen
• Beteiligte Person: Professor Dr. Jochen Hampe