Molekularer Mechanismus der bakteriellen Membraninsertase YidC

• Antragsteller: Professor Dr. Andreas Kuhn
• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung von 2001 bis 2008
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5337410

Der Membraneinbau bakterieller Proteine benötigt ein erst kürzlich identifiziertes Membranprotein YidC (Samuelson et al.). Homologe Proteine in Mitochondrien (Osa-1) und Chloroplasten (albino3) deuten auf einen phylogenetisch konservierten Mechanismus der Proteininsertion hin. Hybridproteine zwischen Oxa-1 und YidC werden auf ihre Funktionalität in E. coli getestet, um die gemeinsamen und essentiellen Teile des Enzyms zu identifizieren. Gezielte Deletionen und Punktmutationen sollen ebenfalls die funktionellen Domänen von YidC nachweisen. In einem in vitro System soll das gereinigte und rekonsitutierte Enzym biochemisch charakterisiert werden. Als Modellproteine bzw. YidC-Substrate dienen hier die bereits gut untersuchten Coatproteine der Bakteriophagen M13 und Pf3. Dabei soll geklärt werden, ob YidC auch unabhängig von der Sec-Translocase funktionsfähig ist. Durch Bindungstests von Mutantenproteine soll außerdem untersucht werden, wie YidC seine Substrate erkennt.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen