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Theory of the conformation dynamics of peptides and of their nonlinear spectroscopy with modern methods of statistical mechanics

Applicant Dr. Susanne Hahn
Subject Area Physical Chemistry of Molecules, Liquids and Interfaces, Biophysical Chemistry
Term from 2001 to 2004
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5337664
 
Das vorliegende Projekt befasst sich mit der thermisch induzierten Konformationsdynamik von Peptiden und Biomolekülen. Ein wichtiger Punkt besteht darin, nummerische Verfahren zur Simulation neuer spektroskopischer Experimente zu entwickeln, mit denen es möglich ist, Konformationsänderungen grosser Moleküle zeitaufgelöst zu detektieren. Zum Studium dieser Prozesse, die für biologische Systeme z.B. in Hinblick auf die Proteinfaltung sehr wichtig sind, sollen klassische Monte-Carlo-Verfahren oder Molekular-Dynamik-Methoden eingesetzt werden, die es erlauben, Übergangsraten und Reaktionswege zu bestimmen. Weiterhin sollen quantenchemische Effekte anhand einfacher Modelle von Peptiden analysiert werden, wobei insbesondere auch Lösungsmitteleinflüsse untersucht werden sollen. In diesem Zusammenhang sollen auch durch geeignete Näherungen Quantenkorrekturen in klassische Rechnungen einbezogen werden, so dass z.B. Tunnelprozesse approximiert werden können.
DFG Programme Emmy Noether International Fellowships
Participating Person Professor Dr. David Chandler
 
 

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