The WW-domain as a model system for the analysis of essential interactions in beta-sheets by incorporation of synthetic building blocks.

• Applicant: Dr. Rudolf Volkmer
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2002 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5469485

WW-Domänen sollen als Modelle zum Studium des Einflusses einzelner Wechselwirkungen auf die Stabilität und den Faltungsweg von Faltblattstrukturen dienen. Durch den Einbau von nicht-natürlichen Aminosäuren oder ausgesuchter Bausteine mittels Festphasensynthese sollen strukturelle Änderungen auf chemischem Weg in das Faltblatt bzw. Turns eingeführt werden. Hierzu wurde eine Reihe von Dipeptidmimetika entworfen mit denen gezielt einzelne Wechselwirkungen (z. B. H-Brücken, Wechselwirkungen der Seitenketten, Flexibilität) beeinflussen werden können. Nach Einbau der Bausteine soll deren Einfluss auf die Stabilität und den Faltungsweg der WW-Domäne oder auf eventuell fassbare Intermediate mit biophysikalischen Methoden quantitativ erfasst werden. Ausgesuchte Analoga der WW-Domäne möchten wir zusätzlich mittels NMR strukturell charakterisieren. Insbesondere vom Einsatz "schneller Kinetik" erhoffen wir uns detailierte Aussagen über das Auftreten von Intermediaten im Faltungsweg.

• DFG Programme: Research Units
• Subproject of: FOR 475: Formation and Stability of beta-Sheets