Hochauflösendes Massenspektrometer (Teilfinanzierung)

• Fachliche Zuordnung: Grundlagen der Biologie und Medizin
• Förderung: Förderung in 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 538898546

Beantragt wird ein hochauflösendes Massenspektrometer mit HPLC-System zur Verstärkung der Infrastrukturplattform des Proteomic Centers der Universität Konstanz. Das beantragte Gerät soll die am Proteomics Center Konstanz durchgeführten Methoden der massenspektrometrisch-basierten Proteomik ergänzen und erweitern und insbesondere im Bereich der nativen Massenspektrometrie verstärken. Das Proteomics Center ist von der DFG als Core Facility zertifiziert. Mit seinem speziellen Fokus auf der Analyse von Proteinen bildet das Proteomics Center die zentrale Infrastrukturplattform für solche massenspektrometrischen Analysen innerhalb der bestehenden Forschungsverbünde eines SFB, eines SFB-Transregio TRR, des internationalen ASAP Research Networks "Cellular Mechanism of LRRK2 in Health and Disease" und der Konstanz Research School Chemical Biology. Auch für eine große Anzahl von Kooperationen im Rahmen der beantragten Forschungsverbünde SFB "Chemical and Biological Principles of Cellular Trigger Responses" sowie des Exzellensclusters EXC_ChemBioStasis spielt das Proteomics Center eine überaus wichtige Rolle. Über 30 experimentell arbeitende Arbeitsgruppen der FB Chemie und Biologie nutzen das Proteomics Center regelmäßig. Ein zentrales und gemeinsames Ziel dieser unterschiedlichen Forschungsverbünde ist es, auf der molekularen Ebene zu verstehen, wie posttranslationale Modifikationen (PTMs) die Funktion von Proteinen und Proteinkomplexen beeinflussen. Das beantragte Gerät soll daher insbesondere zur Untersuchung von Proteinkomplexen und deren dynamische Regulation durch PTMs beitragen. Über die letzten Jahre hinweg konnte das Proteomics Center in Kollaboration mit mehreren Arbeitskreisen an der Universität Konstanz zeigen, dass die Verbindung von Verfahren der Bioorthogonalen Chemie mit MS-basierten Methoden der Proteomik überaus erfolgversprechend dazu eingesetzt werden kann, PTM-spezifische Interaktionspartner zu identifizieren und Protein-Protein Interaktionen zu untersuchen. In der Zukunft wollen wir diesen Ansatz nun für weitere Proteine, Proteinkomplexe, Modulatoren sowie eine größere Anzahl an PTMs ausbauen. Das hier beantragte Massenspektrometer soll es nun ermöglichen, auch intakte Proteine und sehr große Proteinkomplexe mit höchster Auflösung zu vermessen. Die einzigartige Fähigkeit des beantragten Gerätes, derart hochauflösende Daten intakter Proteinkomplexe zu generieren ist dabei essenziell, um weitergehende Informationen über deren Stoichiometrie sowie Umfang ihrer posttranslationalen Modifikationen zu erhalten und den Einfluss unterschiedlicher Modulatoren wie z.B. Lipide, Zucker, oder niedermolekularer Substanzen auf diese Proteinkomplexe zu untersuchen. Das beantragte Gerät wird es uns zudem erlauben, die molekularen Folgen eines möglichen Cross-Talks zwischen unterschiedlichen PTMs sowie die dynamische Regulation von Proteinkomplexen mittels PTMs besser zu verstehen.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: Hochauflösendes Massenspektrometer
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Universität Konstanz
• Leiter: Professor Dr. Florian Stengel