Struktur und Funktion der Genprodukte ORF80 und ORF904 des Plasmides pRN1 aus dem thermoacidophilen Archaeon Sulfolobus islandicus

• Applicant: Privatdozent Dr. Georg Lipps
• Subject Area: Metabolism, Biochemistry and Genetics of Microorganisms
• Term: from 2002 to 2008
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5389881

Das Plasmid pRN1 aus dem thermoacidophilen Crenarchaeoten Sulfolobus islandicus gehört zu der nur unzureichend charakerisierten Plasmidfamilie pRN. Das in der Plasmidfamilie konservierte Protein ORF80 ist ein neuartiges DNA-Bindungsprotein. Es bildet einen größeren, aber spezifischen, DNA-Protein-Komplex auf dem Plasmid pRN1. Die Architektur und Funktion dieses Komplexes soll aufgeklärt werden. Das ebenfalls in der Plasmidfamilie konservierte Protein ORF904 ist multifunktionell: Es besitzt eine dsDNA-abhängige ATPase-, eine Primase- und eine DNA-Polymeraseaktivität. Uns ist kein Protein bekannt welches diese enzymatischen Aktivitäten in einem Polypeptid vereint. Durch die geplanten Experimente soll ORF904 enzymatisch charakterisiert werden und seine Rolle für die Replikation von pRN1 aufgeklärt werden. Ein genaues Studium von ORF904 ist von vordringlichem Interesse, weil ORF904 keine Sequenzähnlichkeit zu anderen Primasen und DNA-Polymerasen aufweist und möglicherweise ein einfaches, evolutionär ursprüngliches Replikationsprotein darstellt. Die Untersuchungen zu ORF80 und ORF904 tragen dazu bei, unser Verständnis für die Plasmidfamilie pRN zu vertiefen, und werden uns langfristig ermöglichen, gezielt einen E.coli-Sulfolobus-Shuttlevektor zu konstruieren.

• DFG Programme: Research Grants