Localisation and visualisation of biological markers and tracking of structures in living cells

• Applicant: Professor Dr. Jürgen Hesser
• Subject Area: Biophysics
• Term: from 2003 to 2006
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5391909

Tracking und Entfaltung sind zwei der Hauptprobleme bei der Analyse von Mikroskopbildern. Viele Anwendungen im Schwerpunkt 1128 basieren auf diesen Techniken, da sie für die quantitative Analyse von zentraler Bedeutung sind. Dieses Projekt wird innerhalb der Forschungskollaboration "Funktionale Chromatin Komplexe" bearbeitet, in der wir eng mit Physikern und Biologen zusammen arbeiten, um die genannten meinsamen Fragestellungen zu lösen. Der Schwerpunkt des Projektes liegt dabei auf der Umsetzung aktueller Ergebnisse der Grundlagenforschung zum Entfaltungsproblem, wie beispielsweise der Regularisierung durch Minimierung der Totalvariation zulässiger Funktionen, sowie der Verfolgung (tracking) einzelner Partikel in Kombination mit Techniken zur Volumenvisualisierung. Durch Adaption der neuen Techniken erwarten wir insgesamt robustere Ergebnisse. Neben der Entwicklung dieser neuen Analysemethoden wollen wir auch in enger Kooperation mit den Mikroskopikern sowohl den experimentellen Aufbau als auch die Analyse gemeinsam optimieren, um ein Maximum an Bild- und Messqualit¨at für die gegebene Mikroskopietechnologie zu erzielen. Wir nennen diesen Ansatz "intelligente Mikroskopie", da durch Kombination von experimentellen und aktuellen algorithmischen Techniken die in Daten verborgene Information weitgehend ausgewertet werden sollte.

• DFG Programme: Priority Programmes
• Subproject of: SPP 1128: Optical Analysis of the Structure and Dynamics of Supra Molecular Biological Complexes
• Participating Person: Professor Dr. Christoph Schnörr