Functional Genomics of Iron Homeostasis in Mice: QTL Mapping of Gene Expression Phenotypes

• Applicant: Dr. Ruth Danzeisen
• Subject Area: Public Health, Healthcare Research, Social and Occupational Medicine
• Term: from 2002 to 2005
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5395097

Fehlregulationen des Eisenstoffwechsels leisten einen signifikanten Beitrag zu der Entstehung vieler Krankheiten. Obwohl solche Krankheiten sehr verbreitet sind, weiß man noch immer erstaunlich wenig darüber, wie Säugetiere und Menschen ihren Eisenstoffwechsel regulieren und modulieren. Bestimmte, durch Inzucht erzeugte, Mäuse-Rassen zeigen deutliche Variabilität in vielen Phänotypen, unter anderem auch im Eisenstoffwechsel. C57BL/6J und DBA/2J Mäuse sind gut charakterisierte Mäuserassen, mit deutlich verschiedenen Fähigkeiten, Eisen aus der Nahrung zu verwerten. Jede dieser zwei Rassen repräsentiert ein Extrem eines ganzen Spektrums von Phänotypen, während die 35 durch Inzucht erzeugten rekombinierten Rassen (C57BL/6J X DBA/2J) Zwischenabstufungen zwischen diesen Extremen repräsentieren. Wir beabsichtigen, jede dieser Mäuserassen einer Eisenmangel Diät auszusetzen. Dann werden wir Gen Expression in ausgewählten Organen messen, unter Zuhilfenahme von cDNA microarrays. Um die genetischen Komponenten, welche die Variabilität im Phänotyp verursachen, zu identifizieren, werden wir eine sogenannte "Quantitative Trait Locus" Analyse nutzen. Des weiteren möchten wir, durch Nutzung neuartiger computergestützter Analyse, Genom-weite Unterschiede in der Gen Expression zwischen den 35 durch Inzucht erzeugten rekombinierten Rassen (C57BL/6J X DBA/2J) beurteilen. Eine solche Analyse würde es uns ermöglichen, die Auswirkungen von Eisenmangel auf einzelne Zellen, oder auf den ganzen Körper, viel effektiver zu charakterisieren, als es je durch traditionelle biochemische Analyse möglich wäre.

• DFG Programme: Research Fellowships