Globalanalyse von cis-Elementen und trans-Faktoren für die Regulation der mRNA-Abundanz während der Stadiendifferenzierung von Trypanonsoma brucei

• Antragstellerin: Professorin Dr. Christine Elizabeth Clayton
• Fachliche Zuordnung: Parasitologie und Biologie der Erreger tropischer Infektionskrankheiten
• Förderung: Förderung von 2003 bis 2008
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5396237

Bei Kinetoplastiden wird Genexpression fast ausschließlich auf post-transkriptioneller Ebene durch regulierten mRNA-Abbau and Anpassung der Translationseffizienz reguliert. Dank der genetischen Manipulierbarkeit kann Trypanosoma brucei damit als einmaliges Modell für fundamentale Mechanismen der posttranskriptionellen Genregulation dienen. Wir planen zeitnah zur Fertigstellung der Genomsequenz eine globale Expressionsanalyse in T. brucei nach Induktion mit Differenzierungsignalen oder nach revers genetischer Manipulation der Expression bereits identifizierter oder aufgrund von Sequenzähnlichkeit vermuteter Komponenten von Signalwegen oder der mRNA-Degradationsmaschinerie. Durch Vergleich der 3`-untranslatierten Bereiche von mRNA-Klassen mit ähnlichen Expressionsmustern sollen Regulationselemente und mit diesen dann die relevanten Bindungsfaktoren und die Kopplung von extrazellulären Signalen und Signalwegen an die Faktoren aufgeklärt werden. Wir erwarten, daß dies das bei Hefe und Säugern erhobene Wissen erweitert und zu einem umfassenderen Verständnis von mRNA-Degradation bei allen Eukaryonten beiträgt.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen