PPR proteins as nucleus-encoded components of the plastid RNA-processing machinery

• Applicant: Professor Dr. Christian Schmitz-Linneweber
• Subject Area: Plant Biochemistry and Biophysics
• Term: from 2003 to 2005
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5401354

Der entscheidende Schritt in der Evolution der eukaryotischen Zellen war die endosymbiotische Aufnahme von Prokaryoten. Die resultierenden genetischen Kompartimente (Kern, Cytosol, Mitochondrien und Plastiden) interagieren auf vielen Ebenen ohne dass bisher viel über Mediatoren dieser Interaktion bekannt wäre. PPR-(Pentatricopeptid Repeat)-Proteine sind in allen untersuchten Eukaryoten, und dort in allen genetischen Kompartimenten, gefunden worden. Es wird vermutet, dass sie Vermittler intermolekularer (Protein-Nukleinsäure; Protein-Protein) Wechselwirkungen sind, allerdings liegen kaum biochemische Daten zu ihrer Funktion vor. Diese Proteinfamilie ist besonders ausgedehnt in Pflanzen, und ein Grossteil ihrer Mitglieder wird laut Strukturvorhersagen in die Organellen importiert. Im Rahmen des hier skizzierten Vorhabens soll über die sogenannte "three-hybrid"- und eine modifizierte SELEX-Technik festgestellt werden, welche RNA-Interaktionspartner PPR-Proteine in Plastiden haben. Parallel dazu soll die biologische Funktion von PPR-Proteinen in einem revers genetischen Ansatz über Disruptions- und RNAi-Repressionslinien in Mais und Arabidopsis analysiert werden.

• DFG Programme: Research Fellowships
• International Connection: France, USA
• Cooperation Partners: Professorin Dr. Alice Barkan, Ph.D.; Professor Dr. I Small