SFB 610:  Variation in Protein Conformation: Cellbiological and Pathological Relevance

• Subject Area: Biology
• Term: from 2002 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5485142

• Final Report Year: 2013

Final Report Abstract

Proteine, die ihren Zustand ändern, spielen eine immer bedeutendere Rolle bei vielen zellulären Prozessen. Schwerpunkt des SFB 610 waren die Untersuchungen von Proteinzuständen und deren Auswirkungen auf zellbiologisch und medizinisch bedeutende Vorgänge. Zentral war dabei jeweils das Protein. Proteinzustände, die charakterisiert wurden, umfassten nicht-kovalente Modifizierungen, Faltungszustände, Konformationsänderungen, Dimer- und Oligomerisierungen. Diese Proteinzustände wurden im Projektbereich A bearbeitet. Die Beeinflussung solcher Zustände durch Liganden und die Entwicklung von hierfür geeigneten Ligandensystemen war der Fokus im Projektbereich B. Im Teilbereich C wurden darüber hinaus kovalente Modifizierungen von Proteinen bearbeitet, die in verschiedenen zellulären Prozessen eine wichtige Rolle spielen. Das Konzept des SFB 610 hat sich über diesen Zeitraum der Förderung vollkommen bewährt. Der Austausch zwischen Halle und Leipzig war äußerst rege und viele hochschulübergreifende Zusammenarbeiten wurden entwickelt, verstärkt oder fokussiert. Die erste Förderperiode war durch die Etablierung einer Vielzahl von neuen Kooperationen gekennzeichnet, die ohne die intensiven Diskussionen vor allem während der externen Workshops sich ansonsten nicht ergeben hätten. In der zweiten Förderperiode haben sich starke Kooperationsfelder herauskristallisiert, die die Zusammenarbeiten auf mehrere Schwerpunkte fokussiert hat. In der dritten Förderperiode wurden wesentliche Ergebnisse erzielt. Während die Proteinzustände stets im Mittelpunkt standen, hatten sich in den letzten Jahren auch inhaltliche Schwerpunkte abgezeichnet. Diese lassen sich am besten mit folgenden Begriffen umschreiben: Strukturelle Charakterisierung von Proteinkonformationsänderungen; G-Protein-gekoppelte Rezeptoren; Enzymmodifizierungen und -modifikationen; Zelluläre Konsequenzen von Proteinzuständen. Anhand dieser vier Forschungsfelder konnte in allen drei Förderperioden die Bedeutung von Proteinzuständen sehr detailliert analysiert werden. Dabei hat sich gezeigt, dass in verstärktem Maße und mit Zunahme unserer Kenntnisse die Projektbereiche stark interagieren, und z. B. zelluläre Konsequenzen von Proteinzuständen durch strukturelle Methoden besser analysiert werden können, molekular definierte Peptide die Funktion von Proteinmodifikationen in zellulären Systemen erklären, rekombinant hergestellte Proteine strukturell und funktionell charakterisiert werden oder molekular und strukturell charakterisierte Enzyme im zellulären Kontext eine Bedeutung erlangen. Besonders bewährt haben sich auch die beiden Z-Projekte, die in vielen Kooperationen essentiell waren.

Publications

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