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SFB 624:  Templates - From Design of Chemical Matrices to Reaction Control

Subject Area Chemistry
Biology
Term from 2002 to 2013
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5485369
 
Final Report Year 2013

Final Report Abstract

Der Sonderforschungsbereich 624 hat sich mit chemischen Templaten befasst. Template (Schablonen) enthalten die Information zur strukturellen Organisation von Objekten, so dass von vielen möglichen geometrischen Anordnungen eine bestimmte deutlich bevorzugt wird. Chemische Template ordnen Atome, Molekülteile oder ganze Moleküle so, dass bei einer Reaktion von mehreren möglichen Produkten eines bevorzugt gebildet wird. Dabei rückten im Verlauf der Laufzeit zunehmend funktionale, über die Synthese hinausgehende Aspekte von Templaten in den Mittelpunkt des Interesses. Die Reaktionssteuerung durch Template ist also nicht auf die kovalente Verknüpfung von Atomen oder Molekülteilen beschränkt, sondern in einem weiter gefassten Umfeld zu sehen. So wurde auch die Wechselwirkung zweier (oder mehrerer) Moleküle oder Molekülteile berücksichtigt, ebenso wie das Abscheiden von Partikeln (Atome, Moleküle und deren Verbände) auf Oberflächen, falls diese Prozesse nicht in einer statistischen Art und Weise verlaufen, sondern durch eine Schablone gesteuert wurden. Im SFB 624 wurden komplexe und funktionale Templatarchitekturen in Lösung, an Grenzflächen und in Festkörpern untersucht. Nach der Topographie werden dabei konvexe, konkave, planare und lineare Template unterschieden. Die Projekte des SFBs sind in eine dieser vier Templatgruppen eingeordnet. Die Arbeiten des SFBs umfassten beispielsweise die Zielsetzungen, (a) die Reaktivität und Selektivität von homogenen und heterogenen Reaktionen zu steuern, (b) neue kovalente Template auszuarbeiten, zur Synthese neuer Architekturen zu nutzen und deren Funktionen zu bestimmen, (c) die Selektivität von (hierarchischen) Selbstorganisationseffekten zu verstehen und zu kontrollieren, (d) Templateffekte in enzymatischen Reaktionen aufzudecken und auszunutzen, (e) Stereokontrolle in enantio- und diastereoselektiven Prozessen auszuüben und (f) neue nanoskalige Materialien zugänglich zu machen. Neben funktionalen Aspekten gab es die methodischen Schwerpunkte (a) theoretische Methoden, (b) Massenspektrometrie, (c) Rastersondenmikroskopie, (d) Ultrakurzzeitspektroskopie und (e) optische Mikroskopie.

Publications

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    S. Jäger, G. Rasched, H. Kornreich-Leshem, M. Engeser, O. Thum, M. Famulok
  • A Versatile Toolbox for Variable DNA Functionalization at High Density. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15071-15082
    S. Jäger, G. Rasched, H. Kornreich-Leshem, M. Engeser, O. Thum, M. Famulok
  • Hierarchical Assembly of Helicate-Type Dinuclear Titanium(IV) Complexes. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10371-10378
    M. Albrecht, S. Mirtschin, M. de Groot, I. Janser, J. Runsink, G. Raabe, M. Kogej, C. A. Schalley, R. Fröhlich
  • Molecular Distortions and Chemical Bonding of a Large π-Conjugated Molecule on a Metal Surface. Physical Review Letters 2005, 94, 036106
    A. Hauschild, K. Karki, B.C.C. Cowie, M. Rohlfing, F.S. Tautz, M. Sokolowski
  • Synthesis of Chiral Self-Assembling Rhombs and Their Characterization in Solution, in the Gas Phase, and at the Liquid-Solid Interface. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17672-17685
    K. S. Jeong, S. J. Kim, U.-S. Shin, M. Kogej, N. T. M. Hai, P. Broekmann, N. Jeong, B. Kirchner, M. Reiher, C. A. Schalley
  • Understanding the Template Preorganization Step of an Artificial Arginine Receptor. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8748-8756
    B. Kirchner, M. Reiher
  • Bridging Rotaxane’s Wheels – Cyclochiral Bonnanes, Angew. Chem. 2006, 118, 7454-7457; Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 7296-7299
    M. Radha Kishan A. Parham, F. Schelhase, A. Yoneva, G. Silva, X. Chen, Y. Okamoto, F. Vögtle
  • Flying Capsules: Mass Spectrometric Detection of Pyrogallarene and Resorcinarene Hexamers. Angew. Chem. 2006, 118, 5339-5342; Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 5214-5218
    N. K. Beyeh, M. Kogej, A. Åhman, K. Rissanen, C. A. Schalley
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    G. Hamm, C. Barth, C. Becker, K. Wandelt, C. R. Henry
  • Biosynthesis of the antibiotic bacillaene, the product of a giant polyketide synthase of the trans-AT type. Angew. Chem. 2007, 46, 8195
    J. Moldenhauer, X.H. Chen, R. Borriss, J. Piel
  • Disorder or Complexity? Understanding a Nanoscale Template Structure on Alumina. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4925
    S. Gritschneder, C. Becker, K. Wandelt, M. Reichling
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    P. Bäuerle, M. Ammann, M. Wilde, G. Götz, E. Mena-Osteritz, A. Rang, C. A. Schalley
  • Polyamide Struts for DNA Architectures. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 4382
    T. L. Schmidt, C. K. Nandi, G. Rasched, P. P. Parui, B. Brutschy, M. Famulok, A. Heckel
  • Spontane Verknotung – Von fadenförmigen Oligoamiden zu Kleeblattknoten. Angew. Chem. 2007, 119, 258-263; Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 254-259
    J. Brüggemann, S. Bitter, S. Müller, W. M. Müller, U. Müller, N. Maier, W. Lindner, F. Vögtle
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    S. S. Zhu, H. Staats, K. Brandhorst, J. Grunenberg, F. Gruppi, E. Dalcanale, A. Lützen, K. Rissanen, C. A. Schalley
  • Construction of DNA Architectures with RNA Hairpins. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 971
    G. Mayer, D. Ackermann, N. Kuhn, M. Famulok
  • DNA Minicircles with Gaps for Versatile Functionalization. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 967
    G. Rasched, D. Ackermann, T. L. Schmidt, P. Broekmann, A. Heckel, M. Famulok
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    T. Nguyen, K. Ishida, H. Jenke-Kodama, E. Dittmann, C. Gurgui, T. Hochmuth, S. Taudien, M. Platzer, C. Hertweck, J. Piel
  • The Role of Intermolecular Interactions on the Electronic and Geometric Structure of a Large π- Conjugated Molecule Adsorbed on a Metal Surface. Physical Review Letters 2008, 100, 136103
    L. Kilian, A. Hauschild, R. Temirov, S. Soubatch, A. Schöll, A. Bendounan, F. Reinert, T.-L. Lee, F.S. Tautz, M. Sokolowski, E. Umbach
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    A. Gansäuer, D. Worgull, K. Knebel, I. Huth, G. Schnakenburg, G.
  • Interaction of Radical Pairs Through-Bond and Through-Space: Scope and Limitations of the Point−Dipole Approximation in Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (29), 10092-10106
    C. Riplinger, J. P. Y. Kao, G. M. Rosen, V. Kathirvelu, G. R. Eaton, S. S. Eaton, A. Kutateladze and F. Neese
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    K. M. Fisch, C. Gurgui, N. Heycke, S. A. van der Sar, S. A. Anderson, V. L. Vebb, S. Taudien, M. Platzer, B. K. Rubio, S. J. Robinson, P. Crews, J. Piel
  • Synthesis and Helicate Formation of a New Family of BINOL-based Bis(bipyrdine) Ligands. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 3621-3630
    J. Bunzen, T. Bruhn, G. Bringmann, A. Lützen
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    T. Chen, G.-B. Pan, H. Wettach, M. Fritzsche, S. Höger, L.-J. Wan, H.-B. Yang, B. H. Northrop, P.J. Stang
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    D. Ackermann, T. L. Schmidt, J. S. Hannam, C. S. Purohit, A. Heckel, M. Famulok
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    N. Dalla Favera, U. Kiehne, J. Bunzen, S. Hytteballe, A. Lützen, C. Piguet
  • Large All-Hydrocarbon Spoked Wheels of High Symmetry: Modular Synthesis, Photophysical Properties, and Surface Assembly. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1410-1423
    D. Mössinger, D. Chaudhuri, T. Kudernac, S. Lei, S. De Feyter, J.M. Lupton, S. Höger
  • Oligomers and Cyclooligomers of Rigid Phenylene–Ethynylene–Butadiynylenes: Synthesis and Self- Assembled Monolayers. Angew. Chem. 2010, 122, 6237-6241
    S.-S. Jester, N. Shabelina, S. M. Le Blanc and S. Höger
  • Empty Helical Nano-Channels with Adjustable Order from Low-Symmetry Macrocycles. Angew. Chem. 2011, 123, 3086-3089
    M. Fritzsche, A. Bohle, D. Dudenko, U. Baumeister, D. Sebastiani, G. Richardt, H. W. Spiess, M. R. Hansen, S. Höger
  • Nanopatterning by Molecular Polygons. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11062-11065
    S.-S. Jester, E. Sigmund, S. Höger
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    T. Argirević, C. Riplinger, J. Stubbe, F. Neese and M. Bennati
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    S.-S. Jester, E. Sigmund, L. M. Röck, S. Höger
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    T. Li, D. Ackermann, A. M. Hall, M. Famulok
    (See online at https://doi.org/10.1021/ja2108883)
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    K. Jensen, H. Niederkrüger, K. Zimmermann, A. L. Vagstad, J. Moldenhauer, N. Brendel, S. Frank, P. Pöplau, C. Kohlhaas, C. A. Townsend, M. Oldiges, C. Hertweck, J. Piel
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    M. Brutschy, M. W. Schneider, M. Mastalerz, S.R. Waldvogel
    (See online at https://doi.org/10.1002/adma.201202786)
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    A. O. Brachmann, D. Reimer, W. Lorenzen, E. Augusto Alonso, Y. Kopp, J. Piel, H. B. Bode
    (See online at https://doi.org/10.1002/anie.201205384)
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    F. Lohmann, D. Ackermann, M. Famulok
  • A Hydrogen-Bond Flip-Flop through a Bjerrum-Type Defect. Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 2602-2605
    M. Olschewski, J. Lindner, and P. Vöhringer
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  • Substrate specificity in ketosynthase domains from trans-AT polyketide synthases. Angew.Chem. Int. Ed. Eng. 2013, 52, 1143-1147
    M. Jenner, S. Frank, A. Kampa, C. Kohlhaas, P. Pöplau, G. S. Briggs, J. Piel, N. J. Oldham
    (See online at https://doi.org/10.1002/anie.201207690)
 
 

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