Der Einfluss des Tumormikromilieus auf die Transformation des Follikulären Lymphoms in ein aggressives Lymphom

• Antragstellerin: Dr. Laura Beckmann
• Fachliche Zuordnung: Hämatologie, Onkologie
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 549204408

Die Transformation des follikulären Lymphoms (FL) in ein aggressives B-Zell-Lymphom ist weiterhin primär für die erkrankungsspezifische Mortalität verantwortlich. Das Tumormikromilieu (TME) spielt eine wichtige Rolle in Entstehung, Progression und Refraktärität des FL, während der Stellenwert in der Transformation unvollständig geklärt ist. Unsere Ergebnisse aus bulk- und Einzelzell-RNA-Sequenzierungen zeigen Veränderungen der Zusammensetzung der Immunzellen im TME, sowie die Entstehung eines dominanten malignen B-Zell-Klons im transformierten FL (tFL). Unsere Hypothese ist, dass die strukturierte räumliche Verteilung der B- und T-Zellen und Monozyten im FL durch die Transformation aufgehoben wird. Weiterhin ist unsere Hypothese, dass die Tumorimmunevasion im tFL eine veränderte Zusammensetzung des TME bedingt, wodurch die follikuläre Struktur zerstört wird. Ziel unseres Projekts ist es, die räumliche Verteilung der Immunzellsubtypen sowie die transkriptionellen Veränderungen in Abhängigkeit der Lokalisation im tFL im Vergleich zum FL zu analysieren (Ziel 1). Die Analyse der Zell-Interaktionen im TME soll zudem die Mechanismen der Immunevasion und der Veränderung der Lymphknotenstruktur im tFL aufdecken (Ziel 2). Für unser Projekt verwenden wir Microarrays (TMAs), die 71 Proben enthalten, darunter 21 gepaarte FL- und tFL-Proben, sowie 5 Proben, welche die Transitionszone von FL zu tFL im selben Schnitt enthalten. Räumliche Transkriptom-Analysen der verschiedenen, durch Antikörper markierten Zellsubtypen werden durchgeführt. Hierzu wird die GeoMx-Plattform verwendet, welche > 18000 Zielgene detektieren und die analysierten Gensignaturen räumlich den verschiedenen Zellpopulationen zuordnen kann. Zusätzlich werden Transkriptomanalysen mittels der LimmaVoom Software sowie mit Gene Set Enrichment Analysen durchgeführt, sodass wir ein globales Bild der spezifischen Gensignaturen sowohl des malignen Klons als auch der infiltrierenden Immunzellen in Abhängigkeit von der räumlichen Anordnung der Zellen im tFL im Vergleich zum FL erhalten (Ziel 1). Des Weiteren werden wir räumliche Proteomanalysen unter Einsatz der CODEX Plattform durchführen. Für unser Projekt wurde ein aus 58 Antikörpern bestehendes Panel etabliert. Mittels computergestützter Segmentierung werden einzelne Zellen inklusive ihres Profils von Oberflächenmarkern detektiert, sowie die räumliche Verteilung verschiedener Zelltypen zueinander sowie ihre Interaktionsmöglichkeiten analysiert. Die Analyse erfolgt mit besonderem Fokus auf die verschiedenen T-Zell-Subtypen inklusive ihres funktionellen Zustands, die Immunevasion der malignen Zellen sowie auf die Interaktionen der follikulären dendritischen Zellen und die inflammatorisch agierenden monozytären Zellen (Ziel 2). Zusammengefasst ermöglicht unser Projekt ein umfassendes Verständnis der Biologie der Transformation des FL zu erlangen, insbesondere hinsichtlich der Veränderungen des TME und den damit einhergehenden strukturellen Veränderungen.

• DFG-Verfahren: WBP Stipendium
• Internationaler Bezug: USA
• Gastgeberin: Dr. Erin Parry