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Projekt
Projekt Z01 – Zentrale Ressourcen- und Informationsstelle für Darmbakterien des Menschen
Antragsteller
Professor Dr. Thomas Clavel; Professor Dr. Jörg Overmann
Fachliche Zuordnung
Mikrobielle Ökologie und Angewandte Mikrobiologie
Förderung
Förderung seit 2025
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 564414043
SPP 2474 hat zum Ziel, das funktionelle Potenzial des menschlichen Darmmikrobioms zu erschließen. Dafür ist der Zugang zu qualitätskontrollierten und gut dokumentierten Bakterienstämmen von ausschlaggebender Bedeutung. Die meisten der geplanten SPP-Projekte benötigen Bakterienisolate ausgewählter Zielarten, definierte synthetische Konsortien oder genomweite Mutanten-Bibliotheken. Als weitere Services werden die Genomsequenzierung, Stammtypisierung, langfristige Hinterlegung definierter Stammsammlungen und Beratung zu Access and Benefit Sharing Regelungen benötigt. Dazu wird im Z01-Projekt die komplementäre Expertise zweier Arbeitsgruppen in diesen Bereichen zusammengeführt und so ein zentrales und spezifisches Serviceangebot zur Unterstützung aller SPP-Projekte bereitgestellt. Ein umfassendes Angebot zur Anaerobenkultivierung mit einem breiten Spektrum an Methoden und hochentwickelter Hardware ermöglicht den SPP-Mitgliedern die Isolierung und anschließende Charakterisierung verschiedener Stämme bakterieller Modellarten sowie neuartiger Bakterien. Die gewonnenen Isolate werden den spezifischen Bedarfen der einzelnen Projekte entsprechend mittels genombasierten taxonomischen und funktionellen Methoden analysiert und phänotypisiert. Zur Sicherung der gewonnenen Isolate wird ein neues, spezifisches und zentrales Hinterlegungsverfahren etabliert. Ein solches effizienteres Hinterlegungsverfahren ist besonders wichtig für die Sicherung großer Stammsammlungen, insbesondere von Transposon-Bibliotheken. Die weiteren Services umfassen das projektspezifische Design synthetischer Gemeinschaften aus kultivierten Darmbakterien (Syncoms), die Erweiterung phänotypischer Datenbanken mit detaillierten Informationen zu allen verfügbaren Stämmen sowie die Erstellung von Webseiten mit spezifischen Such- und Datenintegrationsfunktionen für SPP-Projekte. Mit diesen umfassenden Services wird das Z01-Projekt die Forschungsarbeiten der einzelnen Projekte katalysieren, einen nachhaltigen Mehrwert für die gesamte wissenschaftliche Gemeinschaft schaffen und die Sichtbarkeit des SPP 2474 weltweit erhöhen.
DFG-Verfahren
Schwerpunktprogramme
