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Mikrofluidische Plattform für Peptidarrays

Fachliche Zuordnung Medizin
Förderung Förderung in 2025
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 566187929
 
Das menschliche Kinom besteht aus etwa 500 Mitgliedern und ist für die Modifizierung von fast einem Drittel des menschlichen Proteoms verantwortlich, was die enorme Rolle der Kinasen in der menschlichen Physiologie und Pathologie deutlich macht. Obwohl in den letzten Jahren mehrere „-omics“-Ansätze weit verbreitet waren, konzentrieren sich alle auf die zelluläre und funktionelle Reaktion und nicht auf den ursprünglichen Auslöser, der diese Reaktion verursacht. Bei der Rezeptoraktivierung durch Ligandenbindung ist die erste Reaktion die Initiierung intrazellulärer Signalkaskaden durch die Aktivierung verschiedener Kinasen. Diese Kinasen leiten die notwendigen Signale an den Zellkern weiter, um die Transkription und anschließende Translation zu induzieren, was zu einer zellulären Reaktion führt. Daher sind kinomische Ansätze äußerst wertvoll, um die intrazellulären Signalwege zu erforschen, die zu diesen zellulären Reaktionen führen. Eine Kinomics-Plattform kann die an diesen intrazellulären Signalkaskaden beteiligten Signalwege aufklären, aber auch zur Identifizierung neuer Zielstrukturen und/oder Biomarker verwendet werden und hat daher ein breites Anwendungsspektrum. Basierend auf den beschriebenen Forschungsprojekten und Forschungsfragen muss die Kinomics-Plattform durch die folgenden technischen Merkmale charakterisiert werden: a. Hohe Abdeckung: Die Plattform sollte einen großen Teil des Kinoms abdecken, um wertvolle Daten zu liefern. Idealerweise sollte eine Abdeckung von mindestens 50–60 % erreicht werden, um eine ordnungsgemäße Kinomik durchzuführen. b. Geringer Probeneinsatz: Die Plattform sollte in der Lage sein, mit geringen Einsatzmengen, idealerweise weniger als 20 µg Protein, korrekte Ergebnisse zu liefern. c. Hoher Durchsatz/kurze Laufzeit: Die Plattform sollte in der Lage sein, eine relativ große Probenmenge in kurzer Zeit zu verarbeiten. d. Messung der funktionellen Kinaseaktivität: Die Plattform sollte in der Lage sein, die aktive Funktion von Kinasen zu messen. Eine Kinomics-Plattform, wie sie in diesem Antrag gefordert wird, ist für viele laufende Forschungsgruppen an der Medizinischen Fakultät der RWTH von großer Bedeutung, z. B. im Rahmen des SFB/TRR219 sowie des CRC1328 und geplanter SFB-Initiativen unserer Fakultät. Daher beteiligen sich insgesamt 17 Projektleiter aus 10 Instituten an diesem Antrag. Die Arbeitsgruppe der Hauptantragsteller wird die beantragte Kinomics-Plattform als zentrale Plattform betreiben, um standardisierte Arbeitsabläufe zu gewährleisten. Nach einer ausführlichen Diskussion der spezifischen wissenschaftlichen Fragestellung wird jeder Forscher seine Proben von Interesse bereitstellen und die Mitglieder der Gruppe der Antragsteller werden sowohl für die Akkumulation der kinomischen Daten als auch für die Analyse der resultierenden Daten verantwortlich sein. Dadurch wird eine standardisierte Qualitätskontrolle und eine einheitliche Probenhandhabung gewährleistet.
DFG-Verfahren Forschungsgroßgeräte
Großgeräte Mikrofluidische Plattform für Peptidarrays
Gerätegruppe 3190 Sonstige Geräte der Klinischen Chemie und Molekularbiologie
 
 

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