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Projekt
Umfassende Identifikation von transkriptionellen Regulatoren, die an zellulären Triggerreaktionen beteiligt sind (B07)
Fachliche Zuordnung
Bioinformatik und Theoretische Biologie
Förderung
Förderung seit 2026
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 550938463
Die an der zellulären Triggerreaktion beteiligten RNA-Expressionsregulatoren können auf verschiedene Weise aktiviert werden. Bisher existiert keine experimentelle Methode, die Aktivitätsänderungen aller potenziell beteiligten Regulatoren messen kann. Um diese kritische Lücke zu schließen, werden wir hier ein rechnerisches Framework implementieren, das es ermöglicht, Regulatoraktivitäten aller wichtigen RNA-Isoform-Expressionsregulationsprozesse aus Standard-RNA-Sequenzierungsdaten abzuleiten. Wir werden das Framework der Community zur Verfügung stellen und es nutzen, um die transkriptionellen Regulatoren zu untersuchen, welche die durch den Transforming Growth Factor Beta 1 ausgelöste Epithelial-to-Mesenchymal Transition steuern.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Antragstellende Institution
Universität Konstanz
Teilprojektleiter
Professor Dr. Andreas Gruber, Ph.D.
