Monitoring diversity patterns of active flagellate taxa in different grassland ecosystems as a tool in terrestrial ecology

• Antragsteller: Professor Dr. Antonis Chatzinotas
• Mitantragsteller: Professor Dr. Jens Boenigk
• Fachliche Zuordnung: Ökologie und Biodiversität der Pflanzen und Ökosysteme
• Förderung: Förderung von 2008 bis 2012
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 61949274

Die Ökologie der Protisten wurde bisher durch die Fokussierung auf sog. funktionelle Gruppen, wie z. B. die heterotrophen Nanoflagellaten, eingeschränkt. Neuere Untersuchungen weisen darauf hin, dass bestimmte Flagellaten-Gruppen eine hohe genetische Diversität aufweisen, die mit einer funktionellen Diversifizierung und sogar einer Habitatspezifizität einhergeht. Bisherige molekular-ökologische Arbeiten basieren auf der Analyse der DNA, die nur Aussagen über die potentiell vorhandene Diversität zulässt, da nicht-aktive enzystierte Protisten durch diese Methoden ebenfalls erfasst werden (= potentielle Diversität). In diesem Projekt soll hingegen die ribosomale RNA gezielt als Aktivitätsmarker erfasst werden, um potentiell aktive Flagellaten zu untersuchen (= realisierte Diversität). Mit der Methode der quantitativen PCR soll spezifisch die 18S rRNA für Flagellaten dreier Gruppen (Cercomonaden, Kinetoplastea und Chrysomonaden) in Bodenproben entlang eines Landnutzungsgradienten quantifiziert werden. Die zugrunde liegende Diversität soll mit einer sog. Fingerprintmethode (T-RFLP) aufgeschlüsselt und gegebenenfalls mit Klonbanken genauer beschrieben werden. Des Weiteren soll mit Hilfe der Flow Cytometrie und phylogenetischer Sonden eine Methode zur schnellen und spezifischen Quantifizierung ganzer aktiver Zellen etabliert und angewandt werden. Diese Untersuchungen sollen letztendlich die Erfassung von Diversitätsmustern aktiver Flagellaten als Monitoringwerkzeug in der Landschaftsökologie etablieren.

• DFG-Verfahren: Infrastruktur-Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 1374: Biodiversitäts-Exploratorien
• Internationaler Bezug: Österreich
• Beteiligte Person: Dr. Annelie Pernthaler