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Computational studies of alternating access mechanisms in sodium-dependent secondary transporters (P08)

Fachliche Zuordnung Biophysik
Förderung Förderung von 2008 bis 2012
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 57566863
 
Der Alternating Access Mechanismus ist grundlegend für das Verständnis der Funktion von Membrantransportern. Eine Schlüsselrolle spielt dabei der Zusammenhang zwischen invertiert wiederkehrenden Strukturmotiven dieser Proteine und ihrer Fähigkeit multiple Konformationen einnehmen zu können. Basierend auf dieser Beobachtung sollen die alternierenden Zustände von drei Natrium abhängigen Sekundärtransportern (LeuT, NhaA and BetP) unter Zugrundelegung der experimentellen Daten in einem rechentechnisch vollkommen neuen Ansatz modelliert werden. Die ständigen Fortschritte in der Strukturauflösung dieser drei Transporter erlauben die Anwendung von dynamischen Simulationsrechnungen, um die transportbedingten strukturellen Änderungen und ihren Einfluss auf die Regulation der Transporter zu charakterisieren.
DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche
Antragstellende Institution Goethe-Universität Frankfurt am Main
Mitantragstellende Institution Max-Planck-Institut für Biophysik
Teilprojektleiterin Dr. Lucy Forrest
 
 

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