Design neuer Funktionen für das bakterielle Außenmembranprotein OmpG

• Applicant: Dr. Özkan Yildiz
• Subject Area: Structural Biology
• Term: from 2008 to 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 84806618

OmpG ist ein monomeres Außenmembranprotein aus E. coli, dessen genaue Funktion noch nicht geklärt ist. Aufgrund der Möglichkeit OmpG in größeren Mengen als Einschlusskörper herzustellen, es mit einfachen Mitteln zu reinigen und funktionell zurückzufallen, ist dieses porenbildende Membranprotein für strukturelle Untersuchungen sehr gut geeignet. Auf der Grundlage unserer elektronenmikroskopisch und röntgenkristallographisch bestimmten Strukturen von OmpG sollen im Rahmen des vorliegenden Forschungsvorhabens Porine mit gezielt veränderten Transporteigenschaften und Bindungsspezifitäten entwickelt werden. Naheliegend sind Veränderungen an der funktionellen Porenschleife selbst (Modifikation oder komplette Entfernung), sowie am pH-Sensor (H231 und H261), der die Konformation der Porenschleife kontrolliert. Geplant ist auch, günstig positionierte Reste von OmpG durch Cysteine zu ersetzen, mit dem Ziel, durch Einbau geeigneter Gruppen lichtgesteuerte Kanäle zu erhalten. Neben Elektronenmikroskopie und Röntgenstrukturanalyse werden zur Validierung und Charakterisierung der OmpG-Mutanten auch biochemische und biophysikalische Methoden wie Einkanal-Messungen, FTIR (Fourier Transform Infrared Spectroscopy) und TSF (Transport Specific Fractionation) angewendet.

• DFG Programme: Research Grants
• Host: Professor Dr. Werner Kühlbrandt