Identifizierung neuer Effektoren des Transkriptionsfaktors CUTL1 beim Pankreaskarzinom mit Hilfe der RNA Interference-Library-Technologie

• Applicant: Professor Dr. Patrick Michl
• Subject Area: Gastroenterology
• Term: from 2005 to 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 18776047

Der Transkriptionsfaktor CUTL1 wurde in Vorarbeiten als neuer wichtiger Mediator der Tumor-lnvasivität, als Zielgen der TGFß- und Proteinkinase A (PKA)-Signalwege sowie als neuer prognostischer Marker identifiziert, der mit einer signifikanten Verschlechterung der Prognose assoziiert ist. Ziel des geplanten Projekts ist es, mittels neuartiger Hochdurchsatz-Verfahren Effektoren zu identifizieren, durch die CUTL1 das Wachstum und die Invasivität des Pankreaskarzinoms steuert. Hierbei soll eine sequenzielle Kombination von Expressionsprofil-Analyse mit zwei neuartigen Technologien, der RNA Interference-Library und der reversen Transfektion, zum Einsatz kommen. Zunächst wird anhand eines CUTL1-Expressionsprofils eine Vorselektion transkriptionell regulierter Gene getroffen. Anschließend wird mit Hilfe von zur Verfügung stehenden RNAi-Libraries, die die Möglichkeit zur spezifischen Suppression von bis zu 22000 individuellen Genen bieten, eine funktionelle Hochdurchsatz-Analyse dieser potenziellen Effektoren auf Tumorrelevante Parameter wie Proliferation, Migration, Invasion, Adhäsion und Differenzierung durchgeführt. Diese Untersuchungen werden zum einen im 96-well Format, und zum anderen mittels reverser Transfektion auf Zelltransfektions-Microarrays durchgeführt. Funktionell interessante Gene werden einer weiteren Einzelcharakterisierung in vitro und in vivo unterzogen, um so potenzielle neue therapeutische Ansatzpunkte zu identifizieren.

• DFG Programme: Research Grants