Analyse enzymatischer Prozesse mit Hilfe von linear-skalierenden quantenchemischen Methoden (C07)

• Fachliche Zuordnung: Theoretische Chemie: Elektronenstruktur, Dynamik, Simulation
• Förderung: Förderung von 2011 bis 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 27112786

Der Hauptfokus des Projektes ist die Aufklärung der Mechanismen der aktiven DNA-Demethylierung, wie sie von fundamentaler Bedeutung in der Genexpression und der Differenzierung von Stammzellen ist. Die Studien werden mittels linear-skalierender quantenchemischer(QM) sowie mittels QM/MM (QM / molekülmechanischer) Methoden durchgeführt, die es erlauben zuverlässige Berechnungen an Systemen mit mehr als 1000 Atomen zur Beschreibung des aktiven Zentrums solcher Enzyme durchzuführen. Die Berechnungen sollen ein tieferes Verständnis der Bindungsaffinitäten sowie der katalytischen Aktivität der Enzyme ermöglichen.In einem weiteren Teil des Projektes werden quantenchemische Berechnungen zur Entwicklung einer Reaktivitätsskala für Moleküle als Elektrophile in der aktiven Tasche von Enzymen durchgeführt.Dabei ist das Ziel das Design effektiver, irreversibel bindender Antibiotika.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 749: Dynamik und Intermediate molekularer Transformationen
• Großgeräte: GPU-Cluster
• Gerätegruppe: 7030 Dedizierte, dezentrale Rechenanlagen, Prozeßrechner
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Christian Ochsenfeld