Bioinformatikkern - Integration semantischer Information und Nicht-Standard-Optimierung - Kern für Sequenzierung der nächsten Generation (Z01)

• Fachliche Zuordnung: Medizin
• Förderung: Förderung seit 2012
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 217328187

Das Z1 Projekt unterstützt die Teilprojekte des SFB 1074 bei der bioinformatischen Analyse der Sequenzierungsdaten. Neben Standardanalysen werden heterogene Daten aus öffentlichen Datenbanken und semantisches Domänenwissen integriert, interpretierbare diagnostische Modelle für weiterführende Analysen gehören hier ebenfalls dazu. Algorithmen für Clustering, Klassifikation oder Feature Selektion werden in Abhängigkeit der Projekte und Fragestellung weiterentwickelt und adaptiert. Das Zusammenführen von Multi-Omics Daten im SFB umfasst hierbei auch bulk, panel (CLL und AML) und single-cell sequencing Daten, Mutationssignaturen, CNV-Profile oder Tumorentwicklung.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1074: Experimentelle Modelle und klinische Translation bei Leukämien
• Antragstellende Institution: Universität Ulm
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Hans A. Kestler; Professor Dr. Karsten Rippe