Synthetische genetische Analyse, automatisierte Mikroskopie und Bildanalyse (Z03)

• Fachliche Zuordnung: Medizin
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 264061860

Für alle Projekte, die das Modellsystem Bäckerhefe nutzen (P04 - Schwappach, P06 - Thumm, und P13 - Rehling), wird dieses Service-Projekt mit Hilfe der 'synthetic genetic array' (SGA)-Technologie individuell zugeschnittene Bibliotheken von mutanten Hefestämmen herstellen. Diese Bibliotheken werden es den Teilprojekten ermöglichen, ihre hypothesengetriebenen Arbeitsprogramme effizient durchzuführen. Systematische Ansätze sind ideal für die biologischen Fragen des SFBs geeignet, weil unsere derzeitigen Modelle für die Funktion von kompartmentellen Toren auf der Analyse weniger Reporterproteine beruht. Für die kompartmentellen Kontakte haben systematischen Ansätze wesentliche Fortschritte möglich gemacht und werden weiterhin zu neuen Entdeckungen führen. Das Service-Projekt wird eine Kombination aus Matrixübertragungsroboter, Pipettierroboter, automatisiertem Mikroskop und Bildanalyse-Plattform vorhalten. Die Bildanalyse-Plattform unterstützt systematische Screens von Proteinlokalisationen in Hefe, wird aber auch die Projekte P07 (Kehlenbach) und P10 (Brose) bei der quantitativen Analyse von Lokalisationsassays in Säugerzellen unterstützen und damit den möglichen Durchsatz erheblich steigern.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1190: Transportmaschinerien und Kontaktstellen zellulärer Kompartimente
• Antragstellende Institution: Georg-August-Universität Göttingen
• Teilprojektleiterin: Professorin Dr. Blanche Schwappach-Pignataro