Rechnergestützte Modelle zur Heterogenität und Differenzierung in Neoplasien (A17)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Mathematik
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 278529602

Im Projekt werden wir Computermodelle entwickeln, um die Krebsentwicklung bei Einzelzell- und Einzelmolekülauflösung zu untersuchen, wobei wir uns auf die Fragen des Krebswachstums, der Reaktion auf die Behandlung und des Rückfalls konzentrieren. Wir werden Modelle entwickeln, um Zellreaktionen auf Perturbation durch Arzneimittel vorherzusagen, Unterschiede in der Wachstumsdynamik von Krebs zu untersuchen und die Entwicklung der Methylierungsklonalität während der Behandlung unter Verwendung von Genexpression, offenem Chromatin und DNA-Methylierung als Eingabedaten zu analysieren. Parallel dazu werden populationsgenetische Modelle für das Krebswachstum, die Behandlungsreaktion und die Rückfallwahrscheinlichkeit entwickelt, um die phänotypischen und molekularen Messwerte bei behandelten PDX-Mäusen zu verstehen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1243: Genetische und epigenetische Evolution von hämatopoetischen Neoplasien
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Mitantragstellende Institution: Helmholtz Zentrum München; Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professorin Dr. Christiane Fuchs; Professor Dr. Fabian Theis