Von prädiktiven zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (D01+)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 270050988

Aktuelle Sequenziertechnologien und weitere –omics Methoden liefern wichtige Daten um zu verstehen, wie Akklimatisationsprozesse auf verschiedenen Ebenen der Genregulation gesteuert werden. Zur Integration dieser Daten werden wir ein hierarchisches Modell der Translation entwickeln, welches verschiedene Regulations-Ebenen über die Zeit berücksichtigt und so den Beitrag jeder Ebene quantifizieren kann. Des Weiteren werden wir neue Methoden zur Sequenzierung vollständiger, einzelner RNAs (Oxford Nanopore) anwenden, um weitere Einsichten zur Prozessierung, Modifikation und Translation der Chloroplasten-RNAs in Akklimatisationsprozessen zu gewinnen.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 175: Der Chloroplast als zentraler Knotenpunkt der Akklimatisation bei Pflanzen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr.-Ing. Uwe Ohler