Detailseite
TRR 175: Der Chloroplast als zentraler Knotenpunkt der Akklimatisation bei Pflanzen
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung seit 2016
Webseite
Zur Homepage
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 270050988
Da Pflanzen sich ändernden Umweltbedingungen nicht entkommen können, haben sie eine bemerkenswerte Fähigkeit zur physiologischen Anpassung (Akklimatisation) entwickelt. Der TR175 untersucht insbesondere reversible Antworten auf Änderungen in Lichtintensität und Temperatur. Hierbei hat sich herauskristallisiert, dass der Chloroplast ein zentraler Knotenpunkt ist: er ist sowohl Haupt-Sensor als auch wichtiges Ziel essentieller Akklimatisationsprozesse. Der TR175 führt Wissenschaftler aus München, Kaiserslautern und Berlin/Golm zusammen, um eine einzigartige Expertise auf dem Gebiet der Biologie des Chloroplasten in den drei Modellsystemen Arabidopsis, Tabak und Chlamydomonas zu bündeln. In der ersten Förderperiode haben wir Modulatoren und Integratoren für die Anpassung an Kälte, Hitze und Hochlicht identifiziert und untersucht. Ohne Modulatoren sind entsprechende Umwelt-Anpassungen beeinträchtigt, während man unter Integratoren solche Modulatoren versteht, die in mindestens zwei verschiedenen Anpassungs-Prozessen agieren. Die Verquickung von quantitativen mit systembiologischen Ansätzen haben das Konsortium außergewöhnlich bereichert und haben zusammen mit genetischen und physiologischen Ansätzen ausgeprägte Synergieeffekte herbeigeführt.In der nächsten Förderperiode werden wir die vier tragenden Säulen für den TR175 weiterführen und ausbauen. Säule A untersucht Genetische Modulatoren und wird sich vermehrt mit der Translation im Chloroplasten und längeren Akklimatisationszeiträumen beschäftigen. Säule B nutzt vor allem quantitative Ansätze zur Untersuchung Metabolischer Modulatoren und wird sich in der nächsten Förderperiode auch mit Anpassungen an fluktuierende Lichtintensitäten befassen. Säule C wird bei der Untersuchung von Signal-Modulatoren vermehrt auch das nukleär-cytosolische Kompartiment einbeziehen und Umweltfaktoren wie Trockenheit und fluktuierende Lichtintensitäten berücksichtigen. Säule D wird weiterhin verschiedene bioinformatische Ansätze zur Modellierung von Akklimatisationsvorgängen bezüglich metabolischer Reaktionen, Signalleitungsvorgängen und Genregulationsnetzwerken entwickeln und anwenden. Das Konsortium-übergreifende zentrale wissenschaftliche Projekt Z1 wird wie bisher zentraler Anlaufpunkt für quantitativ-biologische Vorgehensweisen sein und zudem Ansätze aus dem Bereich „Evolution im Labor“ einsetzen, um neue Modulatoren und Integratoren zu ermitteln. In der neuen Förderperiode werden wir zudem Leindotter (Camelina sativa) als Modell-Nutzpflanze nutzen. Insgesamt erwarten wir, dass unsere Untersuchungen der Komponenten und Mechanismen der Akklimatisation im Kontext des Chloroplasten zu neuen Ansätzen führen, die großes Potential haben, eine Anwendung bei Nutzpflanzen zu finden.
DFG-Verfahren
Transregios
Laufende Projekte
- A02 - Das chloroplastidäre Ribonukleoprotein CP29A - Stabilisierung von RNA-Pools im Chloroplasten während der Kälteakklimatisation (Teilprojektleiter Schmitz-Linneweber, Christian )
- A03 - Integratoren, die die Plastiden-RNA-Homöostase als Reaktion auf Umwelt- und Stoffwechselstimuli akklimatisieren (Teilprojektleiter Meurer, Jörg )
- A04 - Identifikation und Charakterisierung chloroplastidärer Modulatoren der Kälteakklimatisation von Photosynthese und Translation (Teilprojektleiter Bock, Ralph ; Zoschke, Reimo )
- A05 - Analyse von co-translational wirkenden Faktoren, die die Biogenese von Chloroplasten-kodierten Proteinen regulieren (Teilprojektleiter Willmund, Felix )
- A06 - Licht- und kälteabhängige Integratoren der Chloroplasten-Genexpression und des C-Metabolismus in Chlamydomonas (Teilprojektleiter Nickelsen, Ph.D., Jörg )
- A07 - PPR Proteine als Modulatoren der Translation und RNA-Stabilität während der Temperatur-Akklimatisation (Teilprojektleiter Ruwe, Hannes )
- A08 - Plastiden-vermittelte Akklimatisierungskinetiken eines Pflanze-Pflanze-Pathosystems (Teilprojektleiterin Wicke, Susann )
- B02 - Die Rolle von Thioredoxinen und der Regulation des Stärkestoffwechsels in der Licht- und Temperaturakklimatisation (Teilprojektleiter Geigenberger, Peter )
- B03 - Bedeutung chloroplastidärer Zucker und der plastidären Hüllmembran bei der Kälteakklimatisation (Teilprojektleiter Neuhaus, Ekkehard ; Trentmann, Oliver )
- B04 - Einfluss der Redoxsignaltransduktion auf den Metabolismus von Plastiden und die Photosynthese (Teilprojektleiter Fernie, Ph.D., Alisdair )
- B06 - Akklimatisation von Transportprozessen über die Chloroplasten Hüllmembranen (Teilprojektleiterin Schwenkert, Serena )
- B07 - Akklimatisation an wechselnde Lichtintensitäten: zyklischer Elektronentransport (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Leister, Dario ; Naranjo, Belen )
- B08 - Nukleotidhomeostase im Chloroplasten und Wechselwirkung mit der Photosynthese während der Kälte-Akklimatisation (Teilprojektleiter Möhlmann, Torsten )
- B09 - Untersuchungen zur Signifikanz des chloroplastidären Im- und Exports von K+ Ionen für die pflanzliche Akklimatisation (Teilprojektleiter Kunz, Hans-Henning )
- C01 - Identifizierung und Charakterisierung neuer Komponenten in PGE- und Akklimatisations-Signalwegen (Teilprojektleiterin Kleine, Tatjana )
- C02 - Aufklärung der chloroplastidären unfolded membrane protein response in Chlamydomonas reinhardtii (Teilprojektleiter Schroda, Michael )
- C04 - Die Rolle des Häm für den plastidären retrograden Signalweg (Teilprojektleiter Grimm, Bernhard )
- C05 - Mechanismen und Komponenten der GUN1/GLK Signalleitung und ihre Bedeutung für die Akklimatisation (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Kaufmann, Kerstin ; Leister, Dario )
- C06 - Regulation der Flavonoidbiosynthese durch plastidäre Signale (Teilprojektleiter Richter, Andreas S. )
- D02 - Gewinnung von Integratoren der Akklimatisation aus –omics Daten mithilfe von Regulationsnetzwerken (Teilprojektleiter Mühlhaus, Timo )
- D03 - Subzelluläre Modellierung metabolischer Akklimatisation (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Klipp, Edda ; Nägele, Thomas )
- INF - Forschungsgetriebene Aufbereitung kontextualisierter Daten für die Pflanzenbiologie (Teilprojektleiter Mühlhaus, Timo )
- Z01 - Quantitativ-biologische Experimente und neue Ansätze zur Identifizierung von Integratoren (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Kleine, Tatjana ; Klipp, Edda ; Leister, Dario ; Neuhaus, Ekkehard ; Ohler, Uwe ; Schmitz-Linneweber, Christian ; Schroda, Michael )
- Z02 - Zentrale Aufgaben (Teilprojektleiter Leister, Dario )
Abgeschlossene Projekte
- A01 - Die Rolle plastidärer RNA-Polymerasen bei der Akklimatisierung (Teilprojektleiterin Kühn, Kristina )
- B05 - Die Bedeutung von OEP16 und OEP40 während der Akklimation an Kälte (Teilprojektleiter Soll, Jürgen )
- C03 - Regulatorische Funktionen Chloroplasten-assoziierter nicht-kodierender RNAs in Akklimatisierungsprozessen (Teilprojektleiter Frank, Wolfgang )
- D01 - Von prädiktiven zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (Teilprojektleiter Ohler, Uwe )
Antragstellende Institution
Ludwig-Maximilians-Universität München
Mitantragstellende Institution
Humboldt-Universität zu Berlin; Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
Beteiligte Institution
Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie (MPI-MP)
Sprecher
Professor Dr. Dario Leister