Mitochondriale Strukturen und Dynamiken in der Licht- und Elektronenmikroskopie (Z03)

• Fachliche Zuordnung: Zellbiologie
• Förderung: Förderung seit 2016
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 269925409

Wir werden die EM- und 3D-EM-Bilderfassung stärker automatisieren, indem wir ein veröffentlichtes Phython-Modul in SerialEMimplementieren. Dies wird es uns ermöglichen, die uns interessierenden Zellen effizienter zu identifizeiren und aufzunehmen, insbesondere bei der Aufnahme von Serienschnitten. In Zusammenarbeit mit dem García-Sáez-Lab werden wir die Mitochondrien-Erkennung für LM-BIlder mit Hilfe von KI- und Deep-Learning-Algorithmen weiter verbessern. Diese Workflows werden wir anpassen, um Mitochondrien in EM-Bildern von Zellen und Gewebe zu identifizieren und zu segmentieren. Hierzu werden wir Trainigsdatensätze aufnehmen und annotieren. Darüber hinaus werden wir unsere CLEM und Super-CLEM-Protokolle weiter an die Bedürfnisse des SFBs anpassen und sie mit der Probenvorbreitung mittels Hochdruckgefrierens kombinieren, um Fixierungsartefakte in der mitochondrialen Ultrastruktur zu vermeiden.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1218: Regulation der zellulären Funktion durch Mitochondrien
• Antragstellende Institution: Universität zu Köln
• Teilprojektleiterinnen: Professorin Dr. Ana Jesús Garcia Sáez, von 7/2020 bis 6/2024; Dr. Astrid Schauss