Project Details
Aberrante DNA-Methylierung von microRNA-Genen in präneoplastischen Leberzellschädigungen und hepatozellulären Karzinomen
Applicant
Professor Dr. Ulrich Lehmann
Subject Area
Gastroenterology
Term
from 2007 to 2011
Project identifier
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5397096
Ziel des vorliegenden Projektes ist es, Veränderungen im DNA-Methylierungsmuster im HCC, die auch bereits in Vorstadien nachweisbar sind, zu definieren. Dabei sollen Methylierungsaberrationen der microRNA-Gene (Hyper- und/oder Hypomethylierung) und deren Auswirkungen auf die Genexpression untersucht werden. Die parallel dazu stattfindende generalisierte Hypomethylierung, die zur chromosomalen Instabilität beiträgt, wird durch Untersuchung repetitiver Sequenzen quantitativ erfaßt. Mögliche Subtypen- und Ätiologie-spezifische DNA-Methylierungsmuster sollen ermittelt und eine potentielle Bedeutung für Diagnostik und Monitoring abgeklärt werden. Dazu werden reine Zellpopulationen durch Laser-Mikrodissektion aus menschlichen Leberbiopsien gewonnen und auf aberrierende DNA-Methylierungen hin untersucht. Sowohl real-time PCR-basierte Verfahren als auch die quantitative Methylierungsanalytik mit Einzel-CpG-Auflösung mittels Pyrosequenzierung werden eingesetzt. Beide Verfahren sind geeignet für die Analyse von konventionell für die Diagnostik fixierten Gewebeproben.
DFG Programme
Clinical Research Units
Subproject of
KFO 119:
Molecular Pathogenesis and Experimental Therapies of Hepatocellular Carcinoma
Participating Person
Professor Dr. Hans Kreipe