GSC 249: Die Hartmut Hoffmann-Berling Internationale Graduiertenschule für Molekular- und Zellbiologie Heidelberg
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die Hartmut Hoffmann-Berling International Graduate School of Molecular & Cellular Biology Heidelberg, im Jahr 2018 umbenannt in Heidelberg Biosciences International Graduate School - nachfolgend „HBIGS“ -, wurde im Oktober 2007 mit dem Ziel gegründet, die motiviertesten und talentiertesten Doktoranden aus aller Welt für eine anspruchsvolle Promotion an der Universität Heidelberg zu gewinnen. Die HBIGS hat sich seitdem zum größten strukturierten Graduiertenprogramm für Lebenswissenschaften an der Universität Heidelberg entwickelt. In der ersten Förderphase hat die HBIGS aus ihrer Sicht wichtige neue Maßnahmen in der Doktorandenausbildung eingeführt, wozu u.a. die Stärkung interdisziplinärer Forschungsansätze, ein strukturiertes Doktorandenprogramm, die Einrichtung individueller Betreuungskomittes („Thesis Advisory Committees“) für Doktoranden, die Einführung eines Berufsvorbereitungskonzepts, die Integration und Weiterentwicklung eines MD/PhD Programms sowie die Förderung von Frauen und Wissenschaftlern mit Familie gehörten. In der zweiten Förderperiode wurde HBIGS von einer thematisch fokussierten Graduiertenschule in eine Graduiertenschule der molekularen Lebenswissenschaften weiterentwickelt, welche die Gesamtheit der lebenswissenschaftlichen Fächer der Universität Heidelberg sowie außeruniversitärer Einrichtungen umfasst. Unter dem Dach der HBIGS wurden im Berichtszeitraum mehr als ein Dutzend nationale und internationale Graduiertenprogramme initiiert und verwaltet. Mit über 80% internationalen Bewerbern respektive 40% internationalen Doktoranden machen die HBIGS zu einer echten internationalen Graduiertenschule, deren akademische Exzellenz durch über 1500 referierte Veröffentlichungen in wissenschaftlichen Fachzeitschriften, eine durchschnittliche Promotionszeit von 4,1 Jahren, eine niedrige Schwundquote von 8%, eine ausgewogene Geschlechterverteilung und ausgezeichnete berufliche Perspektiven für die Promovenden bezeugt wird.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- (2010). Components of the Hippo pathway cooperate with Nek2 kinase to regulate centrosome disjunction. Nat Cell Biol
Mardin BR, Lange C, Baxter JE, Hardy T, Scholz SR, Fry AM, Schiebel E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncb2120) - (2010). Mutations detected in the SHANK2 synaptic scaffolding gene in autism spectrum disorder and mental retardation. Nat Genet
Berkel S, Marshall CR, Weiss B, Howe J, Roeth R, Moog U, Endris V, Roberts W, Szatmari P, Pinto D, Bonin M, Riess A, Engels H, Sprengel R, Scherer SW, Rappold GA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ng.589) - (2010). Stimulation of Cell Adhesion at nanostructured Teflon Interfaces. Advanced Materials
Kruss S, Wolfram T, Martin R, Neubauer S, Kessler H, Spatz JP
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/adma.201003055) - (2011). Hepatic deficiency in transcriptional cofactor TBL1 promotes liver steatosis and hypertriglyceridemia. Cell Metab
Kulozik P, Jones A, Mattijssen F, Rose AJ, Reimann A, Strzoda D, Kleinsorg S, Raupp C, Kleinschmidt J, Müller-Decker K, Wahli W, Sticht C, Gretz N, von Loeffelholz C, Stockmann M, Pfeiffer A, Stöhr S, Dallinga-Thie GM, Nawroth PP, Berriel Diaz M, Herzig S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cmet.2011.02.011) - (2011). Mapping of Signalling Networks through Synthetic Genetic Interaction Analysis by RNAi. Nature Methods
Horn T, Sandmann T, Fischer B, Axelsson E, Huber W, Boutros M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.1581) - (2011). Recruitment and Activation of a Lipid Kinase by Hepatitis C Virus NS5A Is Essential for Integrity of the Membranous Replication Compartment. Cell Host Microbe
Reiss S, Rebhan I, Backes P, Romero-Brey I, Erfle H, Matula P, Kaderali L, Poenisch M, Blankenburg H, Hiet MS, Longerich T, Diehl S, Ramirez F, Balla T, Rohr K, Kaul A, Bühler S, Pepperkok R, Lengauer T, Albrecht M, Eils R, Schirmacher P, Lohmann V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.chom.2010.12.002) - (2012). An extended gamma-tubulin ring functions as a stable platform in microtubule nucleation. J Cell Biol
Erlemann S, Neuner A, Gombos L, Gibeaux R, Anthony C, Schiebel E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1083/jcb.201111123) - (2012). Identification of type I and type II interferon-induced effectors controlling hepatitis C virus replication. Hepatology
Metz P, Dazert E, Ruggieri A, Mazur J, Kaderali L, Kaul A, Zeuge U, Trippler M, Lohmann V, Binder M, Frese M, Bartenschlager R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/hep.25908) - (2012). Rif2 Promotes a Telomere Fold-Back Structure through Rpd3L Recruitment in Budding Yeast. PLoS Genet
Poschke H, Dees M, Chang M, Amberkar S, Kaderali L, Rothstein R, Luke B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002960) - (2012). Site-specific terminal and internal labeling of RNA by poly(A) polymerase tailing and copper-catalyzed or copper-free strainpromoted click chemistry. Nucleic Acids Res
Winz ML, Samanta A, Benzinger D, Jäschke A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gks062) - (2012). Structure and Dynamics of the ATP-Bound Open Conformation of Hsp70 Chaperones. Mol Cell
Kityk R, Kopp J, Sinning I, Mayer MP
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2012.09.023) - (2012). The cisregulatory code of Hox function in Drosophila. EMBO J
Sorge S, Ha N, Polychronidou M, Friedrich J, Bezdan D, Kaspar P, Schaefer MH, Ossowski S, Henz SR, Mundorf J, Rätzer J, Papagiannouli F, Lohmann I
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201593321) - (2012). Ubiquitin-Dependent Intramembrane Rhomboid Protease Promotes ERAD of Membrane Proteins. Mol Cell
Fleig L, Bergbold N, Sahasrabudhe P, Geiger B, Kaltak L, Lemberg MK
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2012.06.008) - (2013). Analysis of hepatitis C virus resistance to silibinin in vitro and in vivo points to a novel mechanism involving nonstructural protein 4B. Hepatology
Esser-Nobis K, Romero-Brey I, Ganten TM, Gouttenoire J, Harak C, Klein R, Schemmer P, Binder M, Schnitzler P, Moradpour D, Bartenschlager R, Polyak SJ, Stremmel W, Penin F, Eisenbach C, Lohmann V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/hep.26260) - (2013). Detecting endogenous SUMO targets in mammalian cells and tissues. Nat Struct Mol Biol
Becker J, Barysch SV, Karaca S, Dittner C, Hsiao HH, Berriel Diaz M, Herzig S, Urlaub H, Melchior F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nsmb.2526) - (2013). Posttranscriptional regulation of the trypanosome heat shock response by a zinc finger protein. PLoS Pathog
Droll D, Minia I, Fadda A, Singh A, Stewart M, Queiroz R, Clayton C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003286) - (2013). Telomeric RNA-DNA hybrids affect telomere-length dynamics and senescence. Nat Struct Mol Biol
Balk B, Maicher A, Dees M, Klermund J, Luke-Glaser S, Bender K, Luke B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nsmb.2662) - (2013). The Lipid Kinase Phosphatidylinositol-4 Kinase III Alpha Regulates the Phosphorylation Status of Hepatitis C Virus NS5A. PLoS Pathog
Reiss S, Harak C, Romero-Brey I, Radujkovic D, Klein R, Ruggieri A, Rebhan I, Bartenschlager R, Lohmann V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003359) - (2013). Tunable Substrates Unveil Chemical Complementation of a Genetic Cell Migration Defect. Adv Healthc Mater
Hellmann JK, Perschmann N, Spatz JP, Frischknecht F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/adhm.201200426) - (2014). A mechanistic framework for noncell autonomous stem cell induction in Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci USA
Daum G, Medzihradszky A, Suzaki T, Lohmann JU
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1406446111) - (2014). A TOGL domain specifically targets yeast CLASP to kinetochores to stabilize kinetochore microtubules. J Cell Biol
Funk C, Schmeiser V, Ortiz J, Lechner J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1083/jcb.201310018) - (2014). A vaccine targeting mutant IDH1 induces antitumour immunity. Nature
Schumacher T, Bunse L, Pusch S, Sahm F, Wiestler B, Quandt J, Menn O, Osswald M, Oezen I, Ott M, Keil M, Balß J, Rauschenbach K, Grabowska AK, Vogler I, Diekmann J, Trautwein N, Eichmüller SB, ..., Wick W, Platten M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature13387) - (2014). Cyclosporin A inhibits Hepatitis B and Hepatitis D Virus entry by Cyclophilin-independent interference with the NTCP receptor. J Hepatol
Nkongolo S, Ni Y, Lempp FA, Kaufman C, Lindner T, Esser-Nobis K, Lohmann V, Mier W, Mehrle S, Urban S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jhep.2013.11.022) - (2014). Cytosolic peroxidases protect the lysosome of bloodstream african trypanosomes from ironmediated membrane damage. PLoS Pathog
Hiller C, Nissen A, Benítez D, Comini MA, Krauth-Siegel RL
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1004075) - (2014). E-CRISP: fast CRISPR target site identification. Nat Methods
Heigwer F, Kerr G, Boutros M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.2812) - (2014). Elements in nucleotide sensing and hydrolysis of the AAA+ disaggregation machine ClpB: a structurebased mechanistic dissection of a molecular motor. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
Zeymer C, Barends TRM, Werbeck ND, Schlichting I, Reinstein J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1107/S1399004713030629) - (2014). Male-female communication triggers calcium signatures during fertilization in Arabidopsis. Nat Commun
Denninger P, Bleckmann A, Lausser A, Vogler F, Ott T, Ehrhardt DW, Frommer WB, Sprunck S, Dresselhaus T, Grossmann G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms5645) - (2014). RGS5 promotes arterial growth during arteriogenesis. EMBO Mol Med
Arnold C, Feldner A, Pfisterer L, Hödebeck M, Troidl K, Genové G, Wieland T, Hecker M, Korff T
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/emmm.201403864) - (2014). RNA Specificity and Regulation of Catalysis in the Eukaryotic Polynucleotide Kinase Clp1. Mol Cell
Dikfidan A, Loll B, Zeymer C, Magler I, Clausen T, Meinhart A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.04.005) - (2014). Signal peptide peptidase functions in ERAD to cleave the unfolded protein response regulator XBP1u. EMBO J
Chen CY, Malchus NS, Hehn B, Stelzer W, Avci D, Langosch D, Lemberg MK
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201488208) - (2014). Structure of the complete bacterial SRP Alu domain. Nucleic Acids Res
Kempf G, Wild K, Sinning I
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gku883) - (2014). The E3 Ligase CUL3/RDX Controls Centromere Maintenance by Ubiquitylating and Stabilizing CENP-A in a CAL1-Dependent Manner. Dev Cell
Bade D, Pauleau AL, Wendler A, Erhardt S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.devcel.2014.01.031) - (2014). The Yeast ER- Intramembrane Protease Ypf1 Refines Nutrient Sensing by Regulating Transporter Abundance. Mol Cell
Avci D, Fuchs S, Schrul B, Fukumori A, Breker M, Frumkin I, Chen CY, Biniossek ML, Kremmer E, Schilling O, Steiner H, Schuldiner M, Lemberg MK
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.10.012) - (2014). Translational Regulation of Specific mRNAs Controls Feedback Inhibition and Survival during Macrophage Activation. PLoS Genet
Schott J, Reitter S, Philipp J, Haneke K, Schäfer H, Stoecklin G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004368) - 2014). Highly efficient CRISPR/Cas9-mediated knock-in in zebrafish by homology-independent DNA repair. Genome Res
Auer TO, Duroure K, De Cian A, Concordet JP, Del Bene F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gr.161638.113) - 2014). Quantitative determination of decitabine incorporation into DNA and its effect on mutation rates in human cancer cells. Nucleic Acids Res
Öz S, Raddatz G, Rius M, Blagitko-Dorfs N, Lübbert M, Maercker C, Lyko F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gku775) - (2015). A Functional Role for VEGFR1 Expressed in Peripheral Sensory Neurons in Cancer Pain. Cancer Cell
Selvaraj D, Gangadharan V, Michalski CW, Kurejova M, Stösser S, Srivastava K, Schweizerhof M, Waltenberger J, Ferrara N, Heppenstall P, Shibuya M, Augustin HG, Kuner R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.ccell.2015.04.017) - (2015). Alleviation of off-target effects from vector-encoded shRNAs via codelivered RNA decoys. Proc Natl Acad Sci USA,
Mockenhaupt S, Grosse S, Rupp D, Bartenschlager R, Grimm D
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1510476112) - (2015). Downregulation of N-terminal acetylation triggers ABA-mediated drought responses in Arabidopsis. Nat Commun
Linster E, Stephan I, Bienvenut WV, Maple-Grødem J, Myklebust LM, Huber M, Reichelt M, Sticht C, Geir Møller S, Meinnel T, Arnesen T, Giglione C, Hell R, Wirtz M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms8640) - (2015). Evidence that hepatitis B virus replication in mouse cells is limited by the lack of a host cell dependency factor. J Hepatol
Lempp FA, Mutz P, Lipps C, Wirth D, Bartenschlager R, Urban S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jhep.2015.10.030) - (2015). Identification and functional characterization of rare SHANK2 variants in schizophrenia. Mol Psychiatry
Peykov S, Berkel S, Schoen M, Weiss K, Degenhardt F, Strohmaier J, Weiss B, Proepper C, Schratt G, Nöthen MM, Boeckers TM, Rietschel M, Rappold GA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/mp.2014.172) - (2015). Intramembrane protease PARL defines a negative regulator of PINK1- and PARK2/Parkin-dependent mitophagy. Autophagy
Meissner C, Lorenz H, Hehn B, Lemberg MK
(Siehe online unter https://doi.org/10.1080/15548627.2015.1063763) - (2015). Nanoscale control of surface immobilized BMP-2: toward a quantitative assessment of BMP-mediated signaling events. Nano Lett
Schwab EH, Pohl TL, Haraszti T, Schwaerzer GK, Hiepen C, Spatz JP, Knaus P, Cavalcanti-Adam EA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.5b00315) - (2015). Operon structure and cotranslational subunit association direct protein assembly in bacteria. Science
Shieh YW, Minguez P, Bork P, Auburger JJ, Guilbride DL, Kramer G, Bukau B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/science.aac8171) - (2015). Regional Cell-Specific Transcriptome Mapping Reveals Regulatory Complexity in the Adult Drosophila Midgut. Cell Rep
Dutta D, Dobson AJ, Houtz PL, Gläßer C, Revah J, Korzelius J, Patel PH, Edgar BA, Buchon N
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.celrep.2015.06.009) - (2015). Somatic CRISPR/Cas9-mediated tumour suppressor disruption enables versatile brain tumour modelling. Nat Commun
Zuckermann M, Hovestadt V, Knobbe-Thomsen CB, Zapatka M, Northcott PA, Schramm K, Belic J, Jones DT, Tschida B, Moriarity B, Largaespada D, Roussel MF, Korshunov A, Reifenberger G, Pfister SM, Lichter P, Kawauchi D, Gronych J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms8391) - (2015). Sox2, Tlx, Gli3 and Her9 converge on Rx2 to define retinal stem cells in vivo. EMBO J
Reinhardt R, Centanin L, Tavhelidse T, Inoue D, Wittbrodt B, Concordet JP, Martinez- Morales JR, Wittbrodt J
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201490706) - (2015). Structural basis for assembly and function of the Nup82 complex in the nuclear pore scaffold. J Cell Biol
Gaik M, Flemming D, von Appen A, Kastritis P, Mücke N, Fischer J, Stelter P, Ori A, Bui KH, Baßler J, Barbar E, Beck M, Hurt E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1083/jcb.201411003) - (2015). The inner workings of the hydrazine synthase multiprotein complex. Nature
Dietl A, Ferousi C, Maalcke WJ, Menzel A, de Vries S, Keltjens JT, Jetten MS, Kartal B, Barends TR
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature15517) - (2015). The serine protease inhibitor Serpin A3N attenuates neuropathic pain by inhibiting T cell-derived leukocyte elastase. Nat Med
Vicuña L, Strochlic DE, Latremoliere A, Bali KK, Simonetti M, Husainie D, Prokosch S, Riva P, Griffin RS, Njoo C, Gehrig S, Mall MA, Arnold B, Devor M, Woolf CJ, Liberles SD, Costigan M, Kuner R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nm.3852) - (2015). Transcriptional refractoriness is dependent on core promoter architecture. Nat Commun
Cesbron F, Oehler M, Ha N, Sancar G, Brunner M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms7753) - (2015). X-domain of peptide synthetases recruits oxygenases crucial for glycopeptide biosynthesis. Nature
Haslinger K, Peschke M, Brieke C, Maximowitsch E, Cryle MJ
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature14141) - 2015). A Time-Calibrated Road Map of Brassicaceae Species Radiation and Evolutionary History. Plant Cell
Hohmann N, Wolf EM, Lysak MA, Koch MA
(Siehe online unter https://doi.org/10.1105/tpc.15.00482) - Compartment-specific aggregases direct distinct nuclear and cytoplasmic aggregate deposition. EMBO J
Miller SB, Ho CT, Winkler J, Khokhrina M, Neuner A, Mohamed MY, Guilbride DL, Richter K, Lisby M, Schiebel E, Mogk A, Bukau B
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201489524) - (2016). A FRET-based study reveals site-specific regulation of spindle position checkpoint proteins at yeast centrosomes. Elife
Gryaznova Y, Koca Caydasi A, Malengo G, Sourjik V, Pereira G
(Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.14029) - (2016). Acetylation-Dependent Control of Global Poly(A) RNA Degradation by CBP/p300 and HDAC1/2. Mol Cell
Sharma S, Poetz F, Bruer M, Ly-Hartig TBN, Schott J, Séraphin B, Stoecklin G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2016.08.030) - (2016). Alternative splicing affects the subcellular localization of Drosha. Nucleic Acids Res
Link S, Grund SE, Diederichs S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkw400) - (2016). Architecture of the 90S pre-ribosome: a structural view on the birth of the eukaryotic ribosome. Cell
Kornprobst M, Turk M, Kellner N, Cheng J, Flemming D, Kos-Braun I, Kos M, Thoms M, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.06.014) - (2016). Blue light-induced LOV domain dimerization enhances the affinity of Aureochrome 1a for its target DNA sequence. Elife
Heintz U, Schlichting I
(Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.11860) - (2016). Global profiling of SRP interaction with nascent polypeptides. Nature
Schibich D, Gloge F, Pöhner I, Björkholm P, Wade RC, von Heijne G, Bukau B, Kramer G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature19070) - (2016). New Structural Data Reveal the Motion of Carrier Proteins in Nonribosomal Peptide Synthesis. Angew Chem Int Ed Engl
Kittilä T, Mollo A, Charkoudian LK, Cryle MJ
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201602614) - (2016). Progress of endocytic CHRN to autophagic degradation is regulated by RAB5-GTPase and T145 phosphorylation of SH3GLB1 at mouse neuromuscular junctions in vivo. Autophagy
Wild F, Khan MM, Straka T, Rudolf R
(Siehe online unter https://doi.org/10.1080/15548627.2016.1234564) - (2016). Protein Abundance Control by Non-coding Antisense Transcription. Cell Rep
Huber F, Bunina D, Gupta I, Khmelinskii A, Meurer M, Theer P, Steinmetz LM, Knop M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.celrep.2016.05.043) - (2016). Regulation of the P450 oxygenation cascade involved in glycopeptide antibiotic biosynthesis. J Am Chem Soc
Peschke M, Haslinger K, Brieke C, Reinstein J, Cryle MJ
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/jacs.6b00307) - (2016). Retinoic acid catabolizing enzyme CYP26C1 is a genetic modifier in SHOX deficiency. EMBO Mol Med
Montalbano A, Juergensen L, Roeth R, Weiss B, Fukami M, Fricke-Otto S, Binder G, Ogata T, Decker E, Nuernberg G, Hassel D, Rappold GA
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/emmm.201606623) - (2016). Sensory input attenuation allows predictive sexual response in yeast. Nat Commun
Banderas A, Koltai M, Anders A, Sourjik V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms12590) - (2016). Stimulated Emission Depletion Nanoscopy Reveals Time-Course of Human Immunodeficiency Virus Proteolytic Maturation. ACS Nano
Hanne J, Göttfert F, Schimer J, Anders-Össwein M, Konvalinka J, Engelhardt J, Müller B, Hell SW, Kräusslich H-G
(Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acsnano.6b03850) - (2016). Structures of human SRP72 complexes provide insights into SRP RNA remodeling and ribosome interaction. Nucleic Acids Res
Becker MM, Lapouge K, Segnitz B, Wild K, Sinning I
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkw1124) - (2016). Sugar Influx Sensing by the Phosphotransferase System of Escherichia coli. PLoS Biol
Somavanshi R, Ghosh B, Sourjik V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pbio.2000074) - (2016). SuReSim: simulating localization microscopy experiments from ground truth models. Nat Methods
Venkataramani V, Herrmannsdörfer F, Heilemann M, Kuner T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/NMETH.3775) - (2016). TALEN/CRISPR-mediated engineering of a promoterless anti-viral RNAi hairpin into an endogenous miRNA locus. Nucleic Acids Res
Senis E, Mockenhaupt S, Rupp D, Bauer T, Paramasivam N, Knapp B, Gronych J, Grosse S, Windisch MP, Schmidt F, Theis FJ, Eils R, Lichter P, Schlesner M, Bartenschlager R, Grimm D
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkw805) - (2016). The Crystal Structure of RosB: Insights into the Reaction Mechanism of the First Member of a Family of Flavodoxin-like Enzymes. Angew Chem Int Ed Engl
Konjik V, Brünle S, Demmer U, Vanselow A, Sandhoff R, Ermler U, Mack M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201610292) - (2016). The RanBP2/RanGAP1*SUMO1/Ubc9 SUMO E3 ligase is a disassembly machine for Crm1- dependent nuclear export complexes. Nat Commun
Ritterhoff T, Das H, Hofhaus G, Schröder RR, Flotho A, Melchior F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms11482) - (2016). Transient RNA-DNA Hybrids Are Required for Efficient Double- Strand Break Repair. Cell
Ohle C, Tesorero R, Schermann G, Dobrev N, Sinning I, Fischer T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.10.001) - (2017). Glutaredoxin catalysis requires two distinct glutathione interaction sites. Nat Commun
Begas P, Liedgens L, Moseler A, Meyer AJ, Deponte M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms14835) - (2017). Heteromeric channels formed by TRPC1, TRPC4 and TRPC5 define hippocampal synaptic transmission and working memory. EMBO J
Bröker-Lai J, Kollewe A, Schindeldecker B, Pohle J, Nguyen Chi V, Mathar I, Guzman R, Schwarz Y, Lai A, Weißgerber P, Schwegler H, Dietrich A, Both M, Sprengel R, Draguhn A, Köhr G, Fakler B, Flockerzi V, Bruns D, Freichel M
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201696369) - (2017). Human phosphatase CDC14A regulates actin organization through dephosphorylation of epithelial protein lost in neoplasm. Proc Natl Acad Sci USA
Chen NP, Uddin B, Hardt R, Ding W, Panic M, Lucibello I, Kammerer P, Ruppert T, Schiebel E
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1619356114) - (2017). Induction of Chromosome Instability by Activation of Yes Associated Protein and Forkhead box M1 in Liver Cancer. Gastroenterology
Weiler SM, Pinna F, Wolf T, Lutz T, Geldiyev A, Sticht C, Knaub M, Thomann S, Bissinger M, Wan S, Rössler S, Becker D, Gretz N, Lang H, Bergmann F, Ustiyan V, Kalin TV, Singer S, Lee JS, Marquardt JU, Schirmacher P, Kalinichenko VV, Breuhahn K
(Siehe online unter https://doi.org/10.1053/j.gastro.2017.02.018) - (2017). Motor neurons control blood vessel patterning in the developing spinal cord. Nat Commun
Himmels P, Paredes I, Adler H, Karakatsani A, Luck R, Marti HH, Ermakova O, Rempel E, Stoeckli ET, Ruiz de Almodóvar C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms14583) - (2017). Neural stem cells induce the formation of their physical niche during organogenesis. Elife
Seleit A, Krämer I, Riebesehl BF, Ambrosio EM, Stolper JS, Lischik CQ, Dross N, Centanin L
(Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.29173) - (2017). Phosphorylation-Dependent Feedback Inhibition of RIG-I by DAPK1 Identified by Kinome-wide siena Screening. Mol Cell
Willemsen J, Wicht O, Wolanski JC, Baur N, Bastian S, Haas DA, Matula P, Knapp B, Meyniel-Schicklin L, Wang C, Bartenschlager R, Lohmann V, Rohr K, Erfle H, Kaderali L, Marcotrigiano J, Pichlmair A, Binder M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2016.12.021) - (2017). Profiling Ssb-Nascent Chain Interactions Reveals Principles of Hsp70-Assisted Folding. Cell,
Döring K, Ahmed N, Riemer T, Suresh HG, Vainshtein Y, Habich M, Riemer J, Mayer MP, O'Brien EP, Kramer G, Bukau B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.06.038) - (2017). Split-BioID a conditional proteomics approach to monitor the composition of spatiotemporally defined protein complexes. Nat Commun
Schopp IM, Amaya Ramirez CC, Debeljak J, Kreibich E, Skribbe M, Wild K, Béthune J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms15690) - (2017). Strigolactone- and Karrikin-Independent SMXL Proteins Are Central Regulators of Phloem Formation. Curr Biol
Wallner ES, López-Salmerón V, Belevich I, Poschet G, Jung I, Grünwald K, Sevilem I, Jokitalo E, Hell R, Helariutta Y, Agustí J, Lebovka I, Greb T
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cub.2017.03.014) - (2017). Structural basis of HypK regulating N-terminal acetylation by the NatA complex. Nat Commun
Weyer FA, Gumiero A, Lapouge K, Bange G, Kopp J, Sinning I
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/ncomms15726) - (2017). Sulfur availability regulates plant growth via glucose-TOR signaling. Nat Commun
Dong Y, Silbermann M, Speiser A, Forieri I, Linster E, Poschet G, Allboje Samami A, Wanatabe M, Sticht C, Teleman AA, Deragon JM, Saito K, Hell R, Wirtz M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-017-01224-w) - (2017). Telomere Length Determines TERRA and R-Loop Regulation through the Cell Cycle. Cell
Graf M, Bonetti D, Lockhart A, Serhal K, Kellner V, Maicher A, Jolivet P, Teixeira MT, Luke B
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.06.006) - (2017). Upregulation of SPS100 gene expression by an antisense RNA via a switch of mRNA isoforms with different stabilities. Nucleic Acids Res
Bunina D, Štefl M, Huber F, Khmelinskii A, Meurer M, Barry JD, Kats I, Kirrmaier D, Huber W, Knop M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1093/nar/gkx737) - (2018). BRI1 controls vascular cell fate in the Arabidopsis root through RLP44 and phytosulfokine signaling. Proc Natl Acad Sci USA
Holzwart E, Huerta AI, Glöckner N, Garnelo Gómez B, Wanke F, Augustin S, Askani JC, Schürholz AK, Harter K, Wolf S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1814434115) - (2018). Capsid protein structure, self-assembly, and processing reveal morphogenesis of the marine virophage mavirus. Proc Natl Acad Sci USA
Born D, Reuter L, Mersdorf U, Mueller M, Fischer MG, Meinhart A, Reinstein J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1805376115) - (2018). Clathrin-adaptor ratio and membrane tension regulate the flat-to-curved transition of the clathrin coat during endocytosis. Nat Commun
Bucher D, Frey F, Sochacki KA, Kummer S, Bergeest JP, Godinez WJ, Kräusslich HG, Rohr K, Taraska JW, Schwarz US, Boulant S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-03533-0) - (2018). Identification, Biosynthesis, and Decapping of NAD-Capped RNAs in B. subtilis. Cell Rep
Frindert J, Zhang Y, Nübel G, Kahloon M, Kolmar L, Hotz-Wagenblatt A, Burhenne J, Haefeli WE, Jäschke A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.07.047) - (2018). Mapping degradation signals and pathways in a eukaryotic N-terminome. Mol Cell
Kats I, Khmelinskii A, Kschonsak M, Huber F, Knieß R, Bartosik A, Knop M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2018.03.033) - (2018). Neurovascular Communication during CNS Development. Dev Cell
Paredes I, Himmels P, Ruiz de Almodóvar C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.devcel.2018.01.023) - (2018). Phenotypic memory in Bacillus subtilis links dormancy entry and exit by a spore quantity-quality tradeoff. Nat Commun
Mutlu A, Trauth S, Ziesack M, Nagler K, Bergeest JP, Rohr K, Becker N, Höfer T, Bischofs IB
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-017-02477-1) - (2018). Secretion of Hepatitis C Virus Replication Intermediates Reduces Activation of Toll Like Receptor 3 in Hepatocytes. Gastroenterology
Grünvogel O, Colasanti O, Lee JY, Klöss V, Belouzard S, Reustle A, Esser-Nobis K, Hesebeck-Brinckmann J, Mutz P, Hoffmann K, Mehrabi A, Koschny R, Vondran FWR, Gotthardt D, Schnitzler P, Neumann-Haefelin C, Thimme R, Binder M, Bartenschlager R, Dubuisson J, Dalpke AH, Lohmann V
(Siehe online unter https://doi.org/10.1053/j.gastro.2018.03.020) - (2018). SHRED Is a Regulatory Cascade that Reprograms Ubr1 Substrate Specificity for Enhanced Protein Quality Control during Stress. Mol Cell
Szoradi T, Schaeff K, Garcia-Rivera EM, Itzhak DN, Schmidt RM, Bircham PW, Leiss K, Diaz-Miyar J, Chen VK, Muzzey D, Borner GHH, Schuck S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.molcel.2018.04.027) - (2018). Single event visualization of unconventional secretion of FGF2. J Cell Biol
Dimou E, Cosentino K, Platonova E, Ros U, Sadeghi M, Kashyap P, Katsinelos T, Wegehingel S, Noé F, García-Sáez AJ, Ewers H, Nickel W
(Siehe online unter https://doi.org/10.1083/jcb.201802008) - (2018). The lncRNA CASC9 and RNA binding protein HNRNPL form a complex and coregulate genes linked to AKT signaling. Hepatology
Klingenberg M, Groß M, Goyal A, Polycarpou-Schwarz M, Miersch T, Ernst AS, Leupold J, Patil N, Warnken U, Allgayer H, Longerich T, Schirmacher P, Boutros M, Diederichs S
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/hep.30102) - (2018). The ng_ζ1 toxin of the gonococcal epsilon/zeta toxin/antitoxin system drains precursors for cell wall synthesis. Nat Commun
Rocker A, Peschke M, Kittilä T, Sakson R, Brieke C, Meinhart A
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/s41467-018-03652-8)