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SFB 1381: Dynamische Organisation zellulärer Proteinmaschinerien: Von der Biogenese und modularen Assemblierung zur Funktion
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung seit 2019
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Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 403222702
Komplexe biologische Funktionen werden von multimeren Proteinverbünden ausgeführt, die als molekulare Maschinerien agieren. Diese Proteinmaschinerien spielen eine zentrale Rolle bei der Replikation, Reparatur und Transkription von DNA, der Translation, Faltung und dem Abbau von Proteinen, dem Energiestoffwechsel, dem Transport von Molekülen, und bei der Kommunikation zwischen Organellen und Zellen. Während die einzelnen Untereinheiten von Proteinkomplexen oft bekannt sind, besteht die große Herausforderung darin die schrittweise Assemblierung dieser Einheiten in makromolekulare Komplexe und den damit verbundenen funktionellen Gewinn aufzuklären, der weit über die individuellen Funktionen der einzelnen Komponenten hinausgeht. Darüber hinaus sind Proteinmaschinerien keine isolierten Einheiten, sondern häufig mit weiteren Proteinkomplexen in dynamische Netzwerke eingebettet. Diese können partiell oder vollständig disassemblieren, als Reaktion auf die Interaktion mit Liganden, durch Modifikationen oder aufgrund von metabolischen Änderungen. Unser interdisziplinärer Ansatz kombiniert Molekular- und Zellbiologie, Biophysik und Strukturbiologie und ermöglicht damit die umfassende Analyse der Biogenese und Assemblierung von komplexen Proteinmaschinerien auf molekularer Ebene sowie die Untersuchung der funktionellen Leistung und regulatorischen Kontrolle durch zelluläre Erfordernisse. Mit dieser einzigartigen Expertise untersucht der SFB1381: i) wie während der Biogenese komplexe Proteinmaschinerien zu funktionellen Einheiten assembliert werden, ii) wie die Funktion von Proteinmaschinerien durch modulare Einheiten bestimmt wird, iii) wie die Proteinmaschinerien zu dynamischen zellulären Netzwerken kombiniert werden und durch externe Stimuli präzise an die Anforderungen und Aufgaben der Zelle angepasst werden. In der ersten Förderperiode haben wir durch die Identifizierung von neuen Untereinheiten und Subkomplexen, detaillierte molekulare Einblicke in die Zusammensetzung der untersuchten Proteinmaschinerien gewonnen. In der zweiten Förderperiode werden wir unsere molekularen und mechanistischen Analysen durch Integration von zellulären Dynamiken und Signalen erweitern, um die assemblierten Proteinmaschinerien und ihre verschiedenen Submodule im räumlichen und zeitlichen zellulären Gesamtkontext zu untersuchen. Hierzu werden wir unsere Kernexpertisen durch die Einbeziehung von Mikroskopietechniken ausbauen, um zu analysieren wie Submodule dynamisch zu einem bestimmten Zeitpunkt und an einem bestimmen Ort gebildet werden, wie Signalwege die (Dis-)Assemblierung regulieren und wie dadurch die Funktion von Proteinmaschinerien an geänderte Bedürfnisse der Zelle angepasst werden. Mit unserem multi-disziplinären Ansatz verfolgen wir ein umfassendes und integratives Forschungsprogramm, um die grundlegenden Mechanismen der Biogenese und der Funktion von multimeren Proteinverbünden aufzuklären, die die zellulären Prozesse des Lebens steuern.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Laufende Projekte
- A01 - Dynamische Assemblierung, Lokalisierung und Rotation des Archaellum (Teilprojektleiterin Albers, Sonja Verena )
- A02 - Dynamische Assemblierung des Bewegungsapparates von Cyanobakterien in Abhängigkeit von Licht (Teilprojektleiterin Wilde, Annegret )
- A03 - Der bakterielle Elektronenbifurkation-Benzoyl-Reduktasekomplex und seine dynamischen Interaktionspartner (Teilprojektleiter Boll, Matthias )
- A04 - Cytochrom c Biogenese mittels Maturasemaschinerien (Teilprojektleiter Einsle, Oliver )
- A05 - Assemblierung und Biogenese des Atmungskettenkomplexes III und assoziierter Superkomplexe (Teilprojektleiterin Hunte, Carola )
- A06 - Regulation von Biogenese und Funktion der mitochondrialen Proteinimportmaschinerie durch Phosphorylierung (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Köhn, Maja ; Meisinger, Chris )
- A07 - Modulare Organisation der Membraninsertions-Maschinerie von mitochondrialen Beta-barrel-Proteinen (Teilprojektleiter Wiedemann, Nils )
- A09 - Die Assemblierung der T Zell Rezeptor-Signalosome (Teilprojektleiter Schamel, Wolfgang )
- B02 - Assemblierung, Dynamik und Funktion von ELAV-Proteinmaschinerien in Nervenzellen (Teilprojektleiterin Hilgers, Valerie )
- B03 - Bestimmung und Charakterisierung der Interaktion und Substrate von MOF (Teilprojektleiterin Akhtar, Ph.D., Asifa )
- B04 - Die vielfältigen Funktionen der mitochondrialen Präsequenzprozessierungs-Maschinerie (Teilprojektleiterin Vögtle, Friederike-Nora )
- B06 - Dynamischer Umbau der Struktur und Funktion von Ribosomen als Reaktion auf metaboli-sche Veränderungen und zellulären Stress (Teilprojektleiter Koch, Hans-Georg )
- B07 - Die Effekte von Nichtgleichgewichtszuständen auf die Organisation von Proteinmaschinerien (Teilprojektleiter Hugel, Thorsten )
- B08 - Zusammenspiel des Hsp70 Ssb mit Ribosomen und Cochaperonen im Cytosol und an der ER Membran (Teilprojektleiterin Rospert, Sabine Karola )
- B09 - Ribonukleinproteinkomplexe kontrollieren die LINE-1 Retrotransposition und Stressantworten (Teilprojektleiter Baumeister, Ralf )
- B10 - Modulare Assemblierung der Autopagiemaschinerie in Mitophagie und Immunität (Teilprojektleiterinnen Gámez-Díaz, Laura ; Kraft, Claudine )
- B12 - Die Dynamik der (Dis-)Assemblierung und der molekularen Organisation der PII Signalmaschinerie (Teilprojektleiter Selim, Khaled )
- Z01 - Massenspektrometrie Plattform zur Analyse dynamischer Proteinmaschinerien (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Drepper, Friedel ; Huesgen, Pitter ; Schulte, Uwe ; Warscheid, Bettina )
- Z02 - Zentrale Koordination des SFB (Teilprojektleiter Meisinger, Chris )
- Z03 - Bildgebungsverfahren zur Analyse der Dynamik von Proteinmaschinerien und ihre Korrelation zu zellulären Topologien (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Hugel, Thorsten ; Kraft, Claudine ; Ott, Thomas )
Abgeschlossene Projekte
- A08 - Biogenese und aktivitätsabhängige Dynamik des AMPA-Rezeptor-Komplexes (Teilprojektleiter Fakler, Bernd )
- B01 - Die KMT9 Proteinmaschinerie, ein neuer Chromatin-Writer (Teilprojektleiter Schüle, Roland )
- B05 - Crosstalk zwischen der mitochondrialen Atmungskette und der cytosolischen Proteinsynthesemaschinerie (Teilprojektleiterin Warscheid, Bettina )
- B11 - Mechanismus und Dynamik der nukleären Lokalisierung des humanen 26S Proteasoms (Teilprojektleiter Haselbach, David )
Antragstellende Institution
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Beteiligte Institution
Max-Planck-Institut für Immunbiologie und Epigenetik
Beteiligte Hochschule
Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
Medizinische Fakultät Heidelberg
Medizinische Fakultät Heidelberg
Sprecher
Professor Dr. Chris Meisinger