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Single cell-based ultra high-resolution characterization of intrathecal immunity in Autoimmune Encephalitis

Subject Area Molecular and Cellular Neurology and Neuropathology
Term from 2019 to 2023
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 417946943
 
Final Report Year 2023

Final Report Abstract

In diesem Projekt haben wir die Immunmechanismen untersucht, die Autoimmunität gegen Neuronen und Synapsen im Rahmen von Autoimmunenzephalitiden (AIE) auslösen. Zu diesem Zweck haben wir ein multi-zentrisches und multinationales Konsortium aufgebaut. Daher ist der Abschlussbericht inhaltlich zentrumsübergreifend verfasst. Wir haben dann die technischen und organisatorischen Voraussetzungen geschaffen, um in allen klinischen Zentren Zellen des Liquor cerebrospinalis und des Bluts mit single cell RNA-sequcing (scRNA-seq) mit hoher Qualität zu prozessieren und diese transkriptionellen Daten mit proteomics und genomics zu integrieren. Wir haben große Kohorten dieser seltenen Erkrankung und ihrer Subtypen gesammelt. Wir haben mit unserem Konsortium unter anderem genome-weite Assoziationsstudien und proteomics Charakterisierungen des Liquors von einzelnen AIE-Subtypen publiziert. Mehrere Manuskripte mit einer mechanistischen Charaktisierung von Erkrankungsmechnismen von AIE-Subtypen sind in Fertigstellung begriffen. Wir haben mehrere Drittmittel-Anträge eingereicht, um unser Konsortium weiter fortzusetzen.

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